Protein–RNA interactions for Protein: Q01279

Egfr, Epidermal growth factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EgfrQ01279 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
EgfrQ01279 Rpl22-204ENSMUST00000139685 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
EgfrQ01279 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
EgfrQ01279 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
EgfrQ01279 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
EgfrQ01279 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
EgfrQ01279 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
EgfrQ01279 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
EgfrQ01279 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
EgfrQ01279 Vsir-202ENSMUST00000105459 1290 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
EgfrQ01279 Cd55b-202ENSMUST00000119432 986 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
EgfrQ01279 Nudt7-204ENSMUST00000134593 707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
EgfrQ01279 Gm10320-201ENSMUST00000170205 527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
EgfrQ01279 H2-Bl-203ENSMUST00000183999 358 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
EgfrQ01279 1700065I16Rik-201ENSMUST00000185277 512 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
EgfrQ01279 Ly6e-207ENSMUST00000187606 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
EgfrQ01279 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
EgfrQ01279 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
EgfrQ01279 Gm45085-201ENSMUST00000209100 441 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
EgfrQ01279 Nutf2-202ENSMUST00000212042 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
EgfrQ01279 Gm39397-201ENSMUST00000212331 228 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
EgfrQ01279 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
EgfrQ01279 Gm17749-201ENSMUST00000216282 690 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
EgfrQ01279 CT009546.1-201ENSMUST00000222573 1120 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
EgfrQ01279 Prss3-201ENSMUST00000096003 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
EgfrQ01279 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
EgfrQ01279 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
EgfrQ01279 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
EgfrQ01279 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
EgfrQ01279 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
EgfrQ01279 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
EgfrQ01279 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
EgfrQ01279 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
EgfrQ01279 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
EgfrQ01279 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
EgfrQ01279 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
EgfrQ01279 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
EgfrQ01279 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
EgfrQ01279 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
EgfrQ01279 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
EgfrQ01279 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
EgfrQ01279 1700010I14Rik-201ENSMUST00000024650 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
EgfrQ01279 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
EgfrQ01279 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
EgfrQ01279 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
EgfrQ01279 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
EgfrQ01279 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
EgfrQ01279 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
EgfrQ01279 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
EgfrQ01279 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
EgfrQ01279 Nrxn1-215ENSMUST00000173917 1439 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
EgfrQ01279 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
EgfrQ01279 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
EgfrQ01279 Gm25053-201ENSMUST00000103982 133 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
EgfrQ01279 Gm22594-201ENSMUST00000104251 130 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
EgfrQ01279 Gm25922-201ENSMUST00000104281 130 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
EgfrQ01279 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
EgfrQ01279 Gm13707-201ENSMUST00000123663 600 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
EgfrQ01279 Gm12756-201ENSMUST00000126294 599 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
EgfrQ01279 Gm24679-201ENSMUST00000158762 111 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
EgfrQ01279 Rps19-ps10-201ENSMUST00000159750 435 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
EgfrQ01279 Gm9081-201ENSMUST00000182346 991 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
EgfrQ01279 Gm7985-201ENSMUST00000183329 981 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
EgfrQ01279 Mrpl20-206ENSMUST00000185148 494 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
EgfrQ01279 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
EgfrQ01279 Gm25053-202ENSMUST00000199731 132 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
EgfrQ01279 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
EgfrQ01279 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
EgfrQ01279 Gm2696-202ENSMUST00000220393 684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
EgfrQ01279 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
EgfrQ01279 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
EgfrQ01279 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
EgfrQ01279 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
EgfrQ01279 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
EgfrQ01279 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
EgfrQ01279 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
EgfrQ01279 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
EgfrQ01279 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
EgfrQ01279 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
EgfrQ01279 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
EgfrQ01279 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
EgfrQ01279 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.11
EgfrQ01279 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
EgfrQ01279 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
EgfrQ01279 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
EgfrQ01279 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
EgfrQ01279 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
EgfrQ01279 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
EgfrQ01279 Bcat2-208ENSMUST00000211173 1684 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
EgfrQ01279 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC14.33□□□□□ -0.11
EgfrQ01279 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC14.33□□□□□ -0.11
EgfrQ01279 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
EgfrQ01279 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
EgfrQ01279 Bpifb4-201ENSMUST00000099181 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
EgfrQ01279 Sgca-202ENSMUST00000103162 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
EgfrQ01279 Gm1110-201ENSMUST00000115261 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
EgfrQ01279 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
EgfrQ01279 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
EgfrQ01279 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
EgfrQ01279 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.3 ms