Protein–RNA interactions for Protein: Q01237

Hmgcr, 3-hydroxy-3-methylglutaryl-coenzyme A reductase, mousemouse

Predictions only

Length 887 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HmgcrQ01237 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HmgcrQ01237 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HmgcrQ01237 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HmgcrQ01237 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HmgcrQ01237 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HmgcrQ01237 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HmgcrQ01237 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HmgcrQ01237 Gm45576-201ENSMUST00000210981 1322 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HmgcrQ01237 2610301B20Rik-202ENSMUST00000101504 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HmgcrQ01237 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HmgcrQ01237 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
HmgcrQ01237 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HmgcrQ01237 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HmgcrQ01237 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HmgcrQ01237 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HmgcrQ01237 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HmgcrQ01237 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
HmgcrQ01237 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HmgcrQ01237 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HmgcrQ01237 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
HmgcrQ01237 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HmgcrQ01237 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HmgcrQ01237 Lyplal1-201ENSMUST00000045388 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HmgcrQ01237 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HmgcrQ01237 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HmgcrQ01237 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HmgcrQ01237 Gm15036-201ENSMUST00000118880 400 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
HmgcrQ01237 Gm12856-201ENSMUST00000119471 1293 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
HmgcrQ01237 1700063K16Rik-201ENSMUST00000190306 369 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
HmgcrQ01237 Gm42779-201ENSMUST00000198807 406 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
HmgcrQ01237 Gm15469-201ENSMUST00000201750 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HmgcrQ01237 Gm44315-201ENSMUST00000203041 219 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
HmgcrQ01237 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HmgcrQ01237 Gm8342-201ENSMUST00000209839 757 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
HmgcrQ01237 Gm45410-201ENSMUST00000211331 1093 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
HmgcrQ01237 Mt1-202ENSMUST00000211807 1085 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
HmgcrQ01237 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
HmgcrQ01237 Sapcd1-201ENSMUST00000040151 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HmgcrQ01237 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HmgcrQ01237 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HmgcrQ01237 Otx2-202ENSMUST00000119070 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HmgcrQ01237 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HmgcrQ01237 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HmgcrQ01237 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HmgcrQ01237 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HmgcrQ01237 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HmgcrQ01237 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HmgcrQ01237 Rpl4-201ENSMUST00000034966 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HmgcrQ01237 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HmgcrQ01237 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HmgcrQ01237 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HmgcrQ01237 Chac2-202ENSMUST00000101394 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HmgcrQ01237 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HmgcrQ01237 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HmgcrQ01237 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HmgcrQ01237 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HmgcrQ01237 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HmgcrQ01237 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HmgcrQ01237 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
HmgcrQ01237 Spdye4a-203ENSMUST00000195900 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HmgcrQ01237 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HmgcrQ01237 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HmgcrQ01237 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HmgcrQ01237 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
HmgcrQ01237 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HmgcrQ01237 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HmgcrQ01237 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HmgcrQ01237 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HmgcrQ01237 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HmgcrQ01237 Nppa-201ENSMUST00000103230 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HmgcrQ01237 Gm14807-201ENSMUST00000116640 983 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
HmgcrQ01237 n-R5s84-201ENSMUST00000122591 109 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
HmgcrQ01237 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HmgcrQ01237 Marcksl1-ps4-201ENSMUST00000132531 291 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
HmgcrQ01237 Gm43377-201ENSMUST00000201640 455 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
HmgcrQ01237 Gm7596-202ENSMUST00000202171 737 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HmgcrQ01237 Gm18204-201ENSMUST00000209835 793 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
HmgcrQ01237 Gm9508-201ENSMUST00000220084 693 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HmgcrQ01237 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
HmgcrQ01237 Rasl11a-201ENSMUST00000031646 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HmgcrQ01237 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HmgcrQ01237 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HmgcrQ01237 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HmgcrQ01237 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HmgcrQ01237 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HmgcrQ01237 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HmgcrQ01237 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HmgcrQ01237 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HmgcrQ01237 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HmgcrQ01237 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HmgcrQ01237 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HmgcrQ01237 5033403F01Rik-201ENSMUST00000181376 1678 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HmgcrQ01237 Llph-201ENSMUST00000020444 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HmgcrQ01237 Oc90-202ENSMUST00000079776 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HmgcrQ01237 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HmgcrQ01237 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HmgcrQ01237 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HmgcrQ01237 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HmgcrQ01237 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HmgcrQ01237 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms