Protein–RNA interactions for Protein: Q00977

Gjb2, Gap junction beta-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb2Q00977 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Gjb2Q00977 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gjb2Q00977 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gjb2Q00977 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gjb2Q00977 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gjb2Q00977 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Gjb2Q00977 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gjb2Q00977 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gjb2Q00977 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gjb2Q00977 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gjb2Q00977 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gjb2Q00977 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gjb2Q00977 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gjb2Q00977 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gjb2Q00977 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gjb2Q00977 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gjb2Q00977 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gjb2Q00977 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gjb2Q00977 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gjb2Q00977 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gjb2Q00977 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gjb2Q00977 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Gjb2Q00977 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Gjb2Q00977 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gjb2Q00977 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gjb2Q00977 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gjb2Q00977 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gjb2Q00977 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Gjb2Q00977 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gjb2Q00977 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gjb2Q00977 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gjb2Q00977 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gjb2Q00977 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Gjb2Q00977 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gjb2Q00977 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gjb2Q00977 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gjb2Q00977 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gjb2Q00977 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gjb2Q00977 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gjb2Q00977 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gjb2Q00977 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gjb2Q00977 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gjb2Q00977 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gjb2Q00977 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gjb2Q00977 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gjb2Q00977 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gjb2Q00977 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gjb2Q00977 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gjb2Q00977 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gjb2Q00977 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gjb2Q00977 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gjb2Q00977 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gjb2Q00977 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gjb2Q00977 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gjb2Q00977 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gjb2Q00977 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gjb2Q00977 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gjb2Q00977 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gjb2Q00977 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gjb2Q00977 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gjb2Q00977 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gjb2Q00977 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gjb2Q00977 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gjb2Q00977 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gjb2Q00977 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gjb2Q00977 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gjb2Q00977 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gjb2Q00977 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gjb2Q00977 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gjb2Q00977 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gjb2Q00977 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gjb2Q00977 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gjb2Q00977 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gjb2Q00977 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gjb2Q00977 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Gjb2Q00977 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gjb2Q00977 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gjb2Q00977 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gjb2Q00977 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gjb2Q00977 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gjb2Q00977 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gjb2Q00977 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gjb2Q00977 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gjb2Q00977 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gjb2Q00977 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gjb2Q00977 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gjb2Q00977 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gjb2Q00977 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gjb2Q00977 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Gjb2Q00977 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gjb2Q00977 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gjb2Q00977 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gjb2Q00977 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gjb2Q00977 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gjb2Q00977 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Gjb2Q00977 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gjb2Q00977 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gjb2Q00977 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gjb2Q00977 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gjb2Q00977 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms