Protein–RNA interactions for Protein: Q00623

Apoa1, Apolipoprotein A-I, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa1Q00623 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Apoa1Q00623 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Apoa1Q00623 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Apoa1Q00623 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Apoa1Q00623 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Apoa1Q00623 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Apoa1Q00623 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Apoa1Q00623 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Apoa1Q00623 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Apoa1Q00623 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Apoa1Q00623 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Apoa1Q00623 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Apoa1Q00623 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Apoa1Q00623 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Apoa1Q00623 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Apoa1Q00623 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Apoa1Q00623 4631405K08Rik-201ENSMUST00000180420 2112 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Apoa1Q00623 Ticam2-201ENSMUST00000070084 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Apoa1Q00623 Gm20649-201ENSMUST00000160950 2740 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Apoa1Q00623 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Apoa1Q00623 Per1-202ENSMUST00000101004 3507 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Apoa1Q00623 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Apoa1Q00623 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Apoa1Q00623 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Apoa1Q00623 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Apoa1Q00623 Vcan-202ENSMUST00000109544 5702 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Apoa1Q00623 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Apoa1Q00623 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Apoa1Q00623 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Apoa1Q00623 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Apoa1Q00623 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Apoa1Q00623 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Apoa1Q00623 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Apoa1Q00623 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Apoa1Q00623 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Apoa1Q00623 Gm45272-203ENSMUST00000211111 1693 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Apoa1Q00623 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Apoa1Q00623 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Apoa1Q00623 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Apoa1Q00623 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Apoa1Q00623 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Apoa1Q00623 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Apoa1Q00623 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Apoa1Q00623 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Apoa1Q00623 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Apoa1Q00623 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Apoa1Q00623 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Apoa1Q00623 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Apoa1Q00623 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Apoa1Q00623 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Apoa1Q00623 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Apoa1Q00623 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Apoa1Q00623 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Apoa1Q00623 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Apoa1Q00623 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Apoa1Q00623 Cit-202ENSMUST00000102560 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Apoa1Q00623 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Apoa1Q00623 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Apoa1Q00623 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Apoa1Q00623 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Apoa1Q00623 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Apoa1Q00623 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Apoa1Q00623 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Apoa1Q00623 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Apoa1Q00623 Scn10a-202ENSMUST00000213392 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Apoa1Q00623 Bpnt1-201ENSMUST00000027916 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Apoa1Q00623 Lamb1-205ENSMUST00000169088 5557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Apoa1Q00623 Gm15991-202ENSMUST00000212123 3565 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Apoa1Q00623 Cdh20-201ENSMUST00000062528 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Apoa1Q00623 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Apoa1Q00623 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Apoa1Q00623 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Apoa1Q00623 Myt1l-201ENSMUST00000021009 5027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Apoa1Q00623 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Apoa1Q00623 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Apoa1Q00623 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Apoa1Q00623 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Apoa1Q00623 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Apoa1Q00623 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Apoa1Q00623 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Apoa1Q00623 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Apoa1Q00623 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Apoa1Q00623 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Apoa1Q00623 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Apoa1Q00623 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Apoa1Q00623 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Apoa1Q00623 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC11.27□□□□□ -0.6
Apoa1Q00623 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Apoa1Q00623 Abi1-203ENSMUST00000093171 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Apoa1Q00623 Zcchc8-204ENSMUST00000196282 4350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Apoa1Q00623 Anxa7-202ENSMUST00000100844 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Apoa1Q00623 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Apoa1Q00623 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Apoa1Q00623 AC129336.1-201ENSMUST00000220224 2277 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Apoa1Q00623 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Apoa1Q00623 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Apoa1Q00623 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Apoa1Q00623 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Apoa1Q00623 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Apoa1Q00623 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms