Protein–RNA interactions for Protein: P81069

Gabpb2, GA-binding protein subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabpb2P81069 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gabpb2P81069 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gabpb2P81069 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gabpb2P81069 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gabpb2P81069 Gripap1-203ENSMUST00000115675 3015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gabpb2P81069 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gabpb2P81069 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gabpb2P81069 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gabpb2P81069 Tns1-209ENSMUST00000187691 2813 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gabpb2P81069 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gabpb2P81069 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gabpb2P81069 Avpr2-202ENSMUST00000101470 2787 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gabpb2P81069 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gabpb2P81069 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gabpb2P81069 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gabpb2P81069 Frmd4a-216ENSMUST00000176828 4355 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gabpb2P81069 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gabpb2P81069 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gabpb2P81069 Pcdhb14-201ENSMUST00000052387 8695 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gabpb2P81069 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gabpb2P81069 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gabpb2P81069 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gabpb2P81069 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gabpb2P81069 Fam53a-203ENSMUST00000065162 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gabpb2P81069 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gabpb2P81069 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gabpb2P81069 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gabpb2P81069 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gabpb2P81069 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gabpb2P81069 Fam53b-207ENSMUST00000106169 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gabpb2P81069 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gabpb2P81069 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gabpb2P81069 Trim9-202ENSMUST00000110522 4405 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gabpb2P81069 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Gabpb2P81069 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gabpb2P81069 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gabpb2P81069 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gabpb2P81069 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Gabpb2P81069 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gabpb2P81069 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gabpb2P81069 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gabpb2P81069 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gabpb2P81069 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gabpb2P81069 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gabpb2P81069 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gabpb2P81069 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gabpb2P81069 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gabpb2P81069 Col6a4-201ENSMUST00000121963 7371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gabpb2P81069 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gabpb2P81069 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gabpb2P81069 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gabpb2P81069 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gabpb2P81069 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gabpb2P81069 Papln-202ENSMUST00000121733 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gabpb2P81069 Hoxa1-201ENSMUST00000000964 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gabpb2P81069 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Gabpb2P81069 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gabpb2P81069 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Gabpb2P81069 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gabpb2P81069 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gabpb2P81069 Gm3716-202ENSMUST00000198582 2879 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gabpb2P81069 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gabpb2P81069 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gabpb2P81069 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Gabpb2P81069 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gabpb2P81069 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gabpb2P81069 Abt1-201ENSMUST00000041782 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gabpb2P81069 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gabpb2P81069 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gabpb2P81069 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gabpb2P81069 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gabpb2P81069 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gabpb2P81069 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gabpb2P81069 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gabpb2P81069 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Gabpb2P81069 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gabpb2P81069 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Gabpb2P81069 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Gabpb2P81069 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Gabpb2P81069 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Gabpb2P81069 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gabpb2P81069 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gabpb2P81069 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gabpb2P81069 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gabpb2P81069 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Gabpb2P81069 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gabpb2P81069 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gabpb2P81069 Fmnl1-202ENSMUST00000042286 3806 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gabpb2P81069 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gabpb2P81069 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gabpb2P81069 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gabpb2P81069 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gabpb2P81069 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gabpb2P81069 Eya1-209ENSMUST00000190337 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gabpb2P81069 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gabpb2P81069 Eya2-201ENSMUST00000063433 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gabpb2P81069 Fntb-201ENSMUST00000041008 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gabpb2P81069 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gabpb2P81069 Ranbp10-201ENSMUST00000041400 5308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gabpb2P81069 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.4 ms