Protein–RNA interactions for Protein: P81067

Irx3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx3P81067 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Irx3P81067 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Irx3P81067 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Irx3P81067 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Irx3P81067 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Irx3P81067 Trim61-201ENSMUST00000078409 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Irx3P81067 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Irx3P81067 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Irx3P81067 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Irx3P81067 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Irx3P81067 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Irx3P81067 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Irx3P81067 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Irx3P81067 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Irx3P81067 Nos3-201ENSMUST00000030834 4132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Irx3P81067 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Irx3P81067 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Irx3P81067 Snx31-203ENSMUST00000161202 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Irx3P81067 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Irx3P81067 Gm43937-201ENSMUST00000204640 3122 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Irx3P81067 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Irx3P81067 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Irx3P81067 Spg20-203ENSMUST00000117341 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Irx3P81067 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Irx3P81067 Vasn-201ENSMUST00000038770 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Irx3P81067 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Irx3P81067 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Irx3P81067 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Irx3P81067 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Irx3P81067 Gnpda2-207ENSMUST00000173927 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Irx3P81067 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Irx3P81067 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Irx3P81067 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Irx3P81067 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Irx3P81067 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Irx3P81067 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Irx3P81067 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Irx3P81067 Sez6l-206ENSMUST00000212758 2664 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Irx3P81067 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Irx3P81067 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Irx3P81067 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Irx3P81067 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Irx3P81067 Trip4-202ENSMUST00000119245 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Irx3P81067 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Irx3P81067 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Irx3P81067 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Irx3P81067 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Irx3P81067 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Irx3P81067 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Irx3P81067 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Irx3P81067 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Irx3P81067 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Irx3P81067 Egfr-202ENSMUST00000102884 2943 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Irx3P81067 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Irx3P81067 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Irx3P81067 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Irx3P81067 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Irx3P81067 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Irx3P81067 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Irx3P81067 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Irx3P81067 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Irx3P81067 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Irx3P81067 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Irx3P81067 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Irx3P81067 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Irx3P81067 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Irx3P81067 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Irx3P81067 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Irx3P81067 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Irx3P81067 Hcrtr2-203ENSMUST00000184757 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Irx3P81067 Gm21103-202ENSMUST00000170923 1761 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Irx3P81067 L3mbtl1-201ENSMUST00000035751 2724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Irx3P81067 Gm26846-201ENSMUST00000181865 4869 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Irx3P81067 Oas1d-201ENSMUST00000044224 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Irx3P81067 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Irx3P81067 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Irx3P81067 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Irx3P81067 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Irx3P81067 Gm45828-201ENSMUST00000206938 1836 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Irx3P81067 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Irx3P81067 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Irx3P81067 Gm6124-201ENSMUST00000188240 2580 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Irx3P81067 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Irx3P81067 AC129336.2-201ENSMUST00000218053 3086 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Irx3P81067 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Irx3P81067 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Irx3P81067 Mrrf-201ENSMUST00000028250 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Irx3P81067 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Irx3P81067 Nectin4-201ENSMUST00000006578 3636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Irx3P81067 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Irx3P81067 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Irx3P81067 4732490B19Rik-201ENSMUST00000130373 2446 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Irx3P81067 Sema4a-201ENSMUST00000029700 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Irx3P81067 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Irx3P81067 Tmem135-202ENSMUST00000117852 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Irx3P81067 Calhm2-201ENSMUST00000035822 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Irx3P81067 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Irx3P81067 AC164099.2-201ENSMUST00000227795 2005 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Irx3P81067 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Irx3P81067 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms