Protein–RNA interactions for Protein: P63072

Ubd, Ubiquitin D, mousemouse

Predictions only

Length 162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UbdP63072 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
UbdP63072 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
UbdP63072 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
UbdP63072 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
UbdP63072 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
UbdP63072 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
UbdP63072 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
UbdP63072 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
UbdP63072 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
UbdP63072 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
UbdP63072 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
UbdP63072 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
UbdP63072 Siglec1-203ENSMUST00000110227 5790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
UbdP63072 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
UbdP63072 Hexim1-201ENSMUST00000053063 3495 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
UbdP63072 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
UbdP63072 Slc5a8-201ENSMUST00000020255 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
UbdP63072 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
UbdP63072 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
UbdP63072 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
UbdP63072 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
UbdP63072 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
UbdP63072 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
UbdP63072 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
UbdP63072 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
UbdP63072 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
UbdP63072 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
UbdP63072 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
UbdP63072 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
UbdP63072 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
UbdP63072 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
UbdP63072 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
UbdP63072 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
UbdP63072 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
UbdP63072 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
UbdP63072 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
UbdP63072 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
UbdP63072 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
UbdP63072 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
UbdP63072 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
UbdP63072 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
UbdP63072 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
UbdP63072 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
UbdP63072 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
UbdP63072 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
UbdP63072 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
UbdP63072 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
UbdP63072 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
UbdP63072 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
UbdP63072 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
UbdP63072 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
UbdP63072 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
UbdP63072 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
UbdP63072 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
UbdP63072 Nod1-201ENSMUST00000060655 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
UbdP63072 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
UbdP63072 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
UbdP63072 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
UbdP63072 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
UbdP63072 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
UbdP63072 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
UbdP63072 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
UbdP63072 Sipa1l3-215ENSMUST00000183096 7713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
UbdP63072 Sipa1l3-201ENSMUST00000085809 7713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
UbdP63072 Thbs2-201ENSMUST00000170872 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
UbdP63072 5330417C22Rik-202ENSMUST00000106625 5836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
UbdP63072 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
UbdP63072 Klhl18-205ENSMUST00000198400 4638 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
UbdP63072 Fam53b-207ENSMUST00000106169 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
UbdP63072 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
UbdP63072 Col20a1-201ENSMUST00000108856 4489 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
UbdP63072 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
UbdP63072 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
UbdP63072 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
UbdP63072 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
UbdP63072 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
UbdP63072 Rtn3-204ENSMUST00000088171 4973 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
UbdP63072 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
UbdP63072 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
UbdP63072 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
UbdP63072 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
UbdP63072 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
UbdP63072 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
UbdP63072 Spice1-201ENSMUST00000050897 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
UbdP63072 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
UbdP63072 Samd4-206ENSMUST00000137543 6874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
UbdP63072 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
UbdP63072 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
UbdP63072 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
UbdP63072 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
UbdP63072 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
UbdP63072 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
UbdP63072 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
UbdP63072 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
UbdP63072 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
UbdP63072 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
UbdP63072 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
UbdP63072 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
UbdP63072 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
UbdP63072 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.5 ms