Protein–RNA interactions for Protein: P58686

UPF0184 protein C9orf16 homolog, mousemouse

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Length 83 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P58686 Carns1-201ENSMUST00000167055 3968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
P58686 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
P58686 4732490B19Rik-201ENSMUST00000130373 2446 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
P58686 Cd19-201ENSMUST00000032968 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
P58686 Tnfsf13b-203ENSMUST00000207792 4771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
P58686 Tex10-206ENSMUST00000164866 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
P58686 Eps8l1-204ENSMUST00000163893 3868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
P58686 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
P58686 Jmjd4-202ENSMUST00000108777 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
P58686 Unkl-201ENSMUST00000015271 3414 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
P58686 Kcne2-201ENSMUST00000047383 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
P58686 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.8
P58686 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
P58686 Pml-202ENSMUST00000114136 4343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
P58686 Oxct1-201ENSMUST00000110690 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
P58686 Slc13a5-202ENSMUST00000137701 1746 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
P58686 Ppp1r12a-205ENSMUST00000219263 3355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
P58686 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
P58686 Sept9-203ENSMUST00000100193 2924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
P58686 Olfr1349-207ENSMUST00000216447 2448 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
P58686 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
P58686 Abhd18-201ENSMUST00000108077 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
P58686 Grin2b-202ENSMUST00000111905 7484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
P58686 Srp54a-207ENSMUST00000110708 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
P58686 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
P58686 Igkv3-12-201ENSMUST00000103396 359 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
P58686 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
P58686 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
P58686 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
P58686 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
P58686 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
P58686 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
P58686 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
P58686 C130060K24Rik-203ENSMUST00000170608 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
P58686 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
P58686 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
P58686 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
P58686 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
P58686 Psenen-203ENSMUST00000207747 669 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
P58686 Proz-203ENSMUST00000211363 984 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
P58686 Gm35850-202ENSMUST00000211705 2120 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
P58686 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
P58686 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
P58686 Dzip1l-203ENSMUST00000112885 4350 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
P58686 Ezr-201ENSMUST00000064234 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
P58686 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
P58686 Phip-201ENSMUST00000034787 10756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
P58686 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
P58686 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
P58686 AC107453.4-201ENSMUST00000227068 1817 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
P58686 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
P58686 Hnrnpc-210ENSMUST00000228232 2535 ntAPPRIS P5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
P58686 Dhx38-201ENSMUST00000042601 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
P58686 AC164099.2-201ENSMUST00000227795 2005 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
P58686 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
P58686 Myo1b-201ENSMUST00000018561 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
P58686 Gm15958-202ENSMUST00000153479 2087 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
P58686 Myh1-203ENSMUST00000124516 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
P58686 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
P58686 B230312C02Rik-201ENSMUST00000145549 1703 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
P58686 Gm18798-201ENSMUST00000187264 1700 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
P58686 Uba1y-ps1-201ENSMUST00000188314 1708 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
P58686 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
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P58686 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
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P58686 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P58686 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P58686 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P58686 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
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P58686 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
P58686 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
P58686 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P58686 Gm8752-201ENSMUST00000173427 1694 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
P58686 Pram1-201ENSMUST00000052079 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P58686 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P58686 Recql-202ENSMUST00000100832 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P58686 Igsf3-202ENSMUST00000195164 3876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
P58686 Nup50-201ENSMUST00000165443 4741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P58686 Ctsb-201ENSMUST00000006235 4743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P58686 4930484H19Rik-201ENSMUST00000218870 1737 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P58686 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P58686 Kat7-205ENSMUST00000107734 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P58686 4930594M22Rik-202ENSMUST00000161599 3595 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P58686 Nrap-204ENSMUST00000166203 5079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms