Protein–RNA interactions for Protein: P56916

Gsc2, Homeobox protein goosecoid-2, mousemouse

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Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gsc2P56916 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gsc2P56916 Cmya5-201ENSMUST00000062122 11850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gsc2P56916 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gsc2P56916 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gsc2P56916 Golga2-203ENSMUST00000113377 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gsc2P56916 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Gsc2P56916 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gsc2P56916 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gsc2P56916 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Gsc2P56916 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Gsc2P56916 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gsc2P56916 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Gsc2P56916 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Gsc2P56916 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Gsc2P56916 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gsc2P56916 AC132881.2-201ENSMUST00000225474 709 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Gsc2P56916 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Gsc2P56916 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Gsc2P56916 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gsc2P56916 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gsc2P56916 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Gsc2P56916 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gsc2P56916 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gsc2P56916 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gsc2P56916 Stard4-201ENSMUST00000025236 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gsc2P56916 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gsc2P56916 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gsc2P56916 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gsc2P56916 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gsc2P56916 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gsc2P56916 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gsc2P56916 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gsc2P56916 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gsc2P56916 Megf10-201ENSMUST00000075770 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gsc2P56916 E130308A19Rik-202ENSMUST00000070150 10856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gsc2P56916 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Gsc2P56916 Myh1-203ENSMUST00000124516 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gsc2P56916 Capn5-201ENSMUST00000040971 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gsc2P56916 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Gsc2P56916 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gsc2P56916 Pkp4-201ENSMUST00000037903 4378 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gsc2P56916 Gm20696-201ENSMUST00000155466 3560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gsc2P56916 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gsc2P56916 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gsc2P56916 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gsc2P56916 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gsc2P56916 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gsc2P56916 Apc-203ENSMUST00000115781 12346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gsc2P56916 Zscan12-203ENSMUST00000225545 4405 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gsc2P56916 Pou6f1-204ENSMUST00000176271 4575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gsc2P56916 Tiam2-201ENSMUST00000072156 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gsc2P56916 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gsc2P56916 Gm37965-201ENSMUST00000195304 1362 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Gsc2P56916 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gsc2P56916 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gsc2P56916 Lhx9-205ENSMUST00000112030 4633 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gsc2P56916 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gsc2P56916 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gsc2P56916 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gsc2P56916 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gsc2P56916 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gsc2P56916 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
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Gsc2P56916 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
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Gsc2P56916 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gsc2P56916 Lsm3-205ENSMUST00000206947 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
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Gsc2P56916 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gsc2P56916 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gsc2P56916 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gsc2P56916 Iqce-201ENSMUST00000041783 6037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gsc2P56916 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gsc2P56916 Mcf2l-222ENSMUST00000173099 6081 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gsc2P56916 Rtn3-204ENSMUST00000088171 4973 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gsc2P56916 Tpx2-206ENSMUST00000164120 4365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gsc2P56916 Zdhhc3-208ENSMUST00000147563 6987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gsc2P56916 Faim2-201ENSMUST00000023750 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gsc2P56916 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gsc2P56916 Dnajc5-203ENSMUST00000108797 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gsc2P56916 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gsc2P56916 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gsc2P56916 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gsc2P56916 Nup50-201ENSMUST00000165443 4741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gsc2P56916 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Gsc2P56916 Trim45-201ENSMUST00000037409 4612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gsc2P56916 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gsc2P56916 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gsc2P56916 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gsc2P56916 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gsc2P56916 Tbc1d14-210ENSMUST00000140607 4649 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gsc2P56916 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gsc2P56916 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gsc2P56916 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gsc2P56916 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gsc2P56916 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gsc2P56916 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
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