Protein–RNA interactions for Protein: P56857

Cldn18, Claudin-18, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn18P56857 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn18P56857 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn18P56857 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn18P56857 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn18P56857 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn18P56857 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn18P56857 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn18P56857 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn18P56857 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn18P56857 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn18P56857 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn18P56857 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn18P56857 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn18P56857 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn18P56857 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn18P56857 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn18P56857 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn18P56857 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn18P56857 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn18P56857 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn18P56857 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn18P56857 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn18P56857 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn18P56857 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn18P56857 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn18P56857 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn18P56857 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn18P56857 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn18P56857 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn18P56857 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn18P56857 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn18P56857 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn18P56857 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn18P56857 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn18P56857 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn18P56857 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn18P56857 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn18P56857 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn18P56857 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn18P56857 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn18P56857 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn18P56857 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn18P56857 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn18P56857 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn18P56857 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn18P56857 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn18P56857 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn18P56857 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn18P56857 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn18P56857 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn18P56857 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn18P56857 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn18P56857 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn18P56857 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn18P56857 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn18P56857 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn18P56857 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn18P56857 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn18P56857 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn18P56857 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn18P56857 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn18P56857 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn18P56857 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn18P56857 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
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Cldn18P56857 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
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Cldn18P56857 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn18P56857 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn18P56857 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn18P56857 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn18P56857 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn18P56857 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn18P56857 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn18P56857 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn18P56857 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn18P56857 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn18P56857 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn18P56857 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn18P56857 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn18P56857 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn18P56857 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn18P56857 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn18P56857 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn18P56857 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn18P56857 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn18P56857 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn18P56857 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn18P56857 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn18P56857 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn18P56857 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn18P56857 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn18P56857 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn18P56857 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn18P56857 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn18P56857 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
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