Protein–RNA interactions for Protein: P50207

Hoxc13, Homeobox protein Hox-C13, mousemouse

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc13P50207 Olfr584-201ENSMUST00000098210 964 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Hoxc13P50207 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Hoxc13P50207 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hoxc13P50207 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hoxc13P50207 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hoxc13P50207 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hoxc13P50207 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hoxc13P50207 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hoxc13P50207 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hoxc13P50207 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hoxc13P50207 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hoxc13P50207 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hoxc13P50207 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hoxc13P50207 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hoxc13P50207 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hoxc13P50207 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hoxc13P50207 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hoxc13P50207 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hoxc13P50207 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hoxc13P50207 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Hoxc13P50207 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Hoxc13P50207 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Hoxc13P50207 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Hoxc13P50207 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Hoxc13P50207 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Hoxc13P50207 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
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Hoxc13P50207 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Hoxc13P50207 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Hoxc13P50207 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Hoxc13P50207 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Hoxc13P50207 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Hoxc13P50207 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
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Hoxc13P50207 Ephx1-201ENSMUST00000036928 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
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Hoxc13P50207 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Hoxc13P50207 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Hoxc13P50207 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Hoxc13P50207 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Hoxc13P50207 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Hoxc13P50207 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Hoxc13P50207 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxc13P50207 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxc13P50207 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxc13P50207 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Hoxc13P50207 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Hoxc13P50207 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Hoxc13P50207 1700013F07Rik-201ENSMUST00000029485 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxc13P50207 Clec4b1-202ENSMUST00000078559 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxc13P50207 Actg-ps1-201ENSMUST00000099636 1124 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxc13P50207 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxc13P50207 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxc13P50207 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Hoxc13P50207 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Hoxc13P50207 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxc13P50207 Gm44190-201ENSMUST00000205083 1401 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxc13P50207 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxc13P50207 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxc13P50207 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxc13P50207 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxc13P50207 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxc13P50207 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxc13P50207 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxc13P50207 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxc13P50207 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxc13P50207 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxc13P50207 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxc13P50207 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxc13P50207 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxc13P50207 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxc13P50207 Platr7-201ENSMUST00000181466 1334 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxc13P50207 Gm45576-201ENSMUST00000210981 1322 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxc13P50207 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxc13P50207 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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