Protein–RNA interactions for Protein: P34928

Apoc1, Apolipoprotein C-I, mousemouse

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Length 88 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc1P34928 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Apoc1P34928 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Apoc1P34928 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Apoc1P34928 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Apoc1P34928 Furin-201ENSMUST00000107362 4166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Apoc1P34928 Invs-201ENSMUST00000030029 5633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Apoc1P34928 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Apoc1P34928 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Apoc1P34928 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Apoc1P34928 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Apoc1P34928 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Apoc1P34928 Chic1-201ENSMUST00000116547 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Apoc1P34928 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Apoc1P34928 Per1-202ENSMUST00000101004 3507 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Apoc1P34928 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Apoc1P34928 Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 5407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Apoc1P34928 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Apoc1P34928 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Apoc1P34928 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Apoc1P34928 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Apoc1P34928 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Apoc1P34928 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Apoc1P34928 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Apoc1P34928 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Apoc1P34928 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Apoc1P34928 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Apoc1P34928 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Apoc1P34928 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Apoc1P34928 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Apoc1P34928 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Apoc1P34928 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Apoc1P34928 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Apoc1P34928 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Apoc1P34928 Pdp2-201ENSMUST00000059588 5692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Apoc1P34928 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Apoc1P34928 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Apoc1P34928 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Apoc1P34928 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Apoc1P34928 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Apoc1P34928 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Apoc1P34928 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Apoc1P34928 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Apoc1P34928 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Apoc1P34928 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Apoc1P34928 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Apoc1P34928 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Apoc1P34928 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Apoc1P34928 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Apoc1P34928 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Apoc1P34928 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Apoc1P34928 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Apoc1P34928 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Apoc1P34928 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Apoc1P34928 Dsc2-201ENSMUST00000039247 4630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Apoc1P34928 Thsd4-206ENSMUST00000171654 8522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Apoc1P34928 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Apoc1P34928 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Apoc1P34928 Agrn-203ENSMUST00000105575 7262 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Apoc1P34928 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Apoc1P34928 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Apoc1P34928 Cep250-204ENSMUST00000109619 7977 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Apoc1P34928 Cep250-201ENSMUST00000039994 7979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Apoc1P34928 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Apoc1P34928 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Apoc1P34928 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Apoc1P34928 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Apoc1P34928 Sema5b-201ENSMUST00000050625 4350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Apoc1P34928 B3galt5-201ENSMUST00000099497 5147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Apoc1P34928 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Apoc1P34928 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Apoc1P34928 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Apoc1P34928 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Apoc1P34928 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Apoc1P34928 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Apoc1P34928 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Apoc1P34928 Supt16-201ENSMUST00000046709 4673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Apoc1P34928 Olfr1490-202ENSMUST00000213900 5165 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Apoc1P34928 Brd3-201ENSMUST00000028282 5419 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Apoc1P34928 Madd-213ENSMUST00000111376 5927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Apoc1P34928 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Apoc1P34928 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Apoc1P34928 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Apoc1P34928 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Apoc1P34928 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Apoc1P34928 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Apoc1P34928 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Apoc1P34928 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Apoc1P34928 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Apoc1P34928 Gm15991-202ENSMUST00000212123 3565 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Apoc1P34928 Lmo7-205ENSMUST00000159314 5774 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Apoc1P34928 Sptan1-204ENSMUST00000113717 7958 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Apoc1P34928 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Apoc1P34928 Gm5124-202ENSMUST00000132683 2083 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Apoc1P34928 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Apoc1P34928 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Apoc1P34928 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Apoc1P34928 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Apoc1P34928 Gm42427-201ENSMUST00000200473 5292 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Apoc1P34928 Smtn-210ENSMUST00000170588 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Apoc1P34928 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
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