Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 CT030170.2-201ENSMUST00000223267 126 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Hoxd10P28359 Pla2g1b-201ENSMUST00000031495 557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hoxd10P28359 C8g-202ENSMUST00000040042 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hoxd10P28359 Gm13306-201ENSMUST00000098122 418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hoxd10P28359 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hoxd10P28359 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hoxd10P28359 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hoxd10P28359 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hoxd10P28359 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hoxd10P28359 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hoxd10P28359 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Hoxd10P28359 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hoxd10P28359 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hoxd10P28359 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hoxd10P28359 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hoxd10P28359 Hddc3-201ENSMUST00000032747 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hoxd10P28359 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hoxd10P28359 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hoxd10P28359 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hoxd10P28359 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hoxd10P28359 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hoxd10P28359 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hoxd10P28359 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hoxd10P28359 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hoxd10P28359 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Hoxd10P28359 Platr19-201ENSMUST00000171380 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Hoxd10P28359 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Hoxd10P28359 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Hoxd10P28359 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Hoxd10P28359 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Hoxd10P28359 Gm15774-201ENSMUST00000141810 2176 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Hoxd10P28359 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Hoxd10P28359 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Hoxd10P28359 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Hoxd10P28359 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Hoxd10P28359 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Hoxd10P28359 Cdk5rap1-202ENSMUST00000109730 1227 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Hoxd10P28359 Gm11578-201ENSMUST00000118530 459 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Hoxd10P28359 Gm12712-201ENSMUST00000120676 801 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Hoxd10P28359 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Hoxd10P28359 Gm10320-201ENSMUST00000170205 527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Hoxd10P28359 Ddt-202ENSMUST00000172820 574 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Hoxd10P28359 Gm43671-201ENSMUST00000200422 433 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Hoxd10P28359 Cdipt-204ENSMUST00000206346 806 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Hoxd10P28359 Gm44953-201ENSMUST00000208745 1286 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Hoxd10P28359 Gm7082-201ENSMUST00000209880 969 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Hoxd10P28359 Retnla-201ENSMUST00000023329 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Hoxd10P28359 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Hoxd10P28359 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Hoxd10P28359 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Hoxd10P28359 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Hoxd10P28359 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Hoxd10P28359 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Hoxd10P28359 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Hoxd10P28359 Sult1a1-201ENSMUST00000106371 1370 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Hoxd10P28359 Sult1a1-202ENSMUST00000106372 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Hoxd10P28359 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Hoxd10P28359 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Hoxd10P28359 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Hoxd10P28359 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Hoxd10P28359 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxd10P28359 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxd10P28359 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxd10P28359 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxd10P28359 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxd10P28359 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxd10P28359 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxd10P28359 Zmynd11-206ENSMUST00000110637 3770 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxd10P28359 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxd10P28359 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxd10P28359 Gm21358-201ENSMUST00000191645 1659 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxd10P28359 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxd10P28359 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxd10P28359 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxd10P28359 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxd10P28359 Tomm5-202ENSMUST00000107808 679 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxd10P28359 Smim11-202ENSMUST00000118064 782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxd10P28359 Snrnp25-202ENSMUST00000121182 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxd10P28359 AC034099.1-202ENSMUST00000133843 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxd10P28359 Gm12069-201ENSMUST00000145127 806 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxd10P28359 Gm17070-201ENSMUST00000170463 784 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxd10P28359 Gm20400-201ENSMUST00000173695 665 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxd10P28359 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxd10P28359 Gm29400-201ENSMUST00000187208 695 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxd10P28359 Gm28662-201ENSMUST00000188446 695 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxd10P28359 Gm28251-201ENSMUST00000188835 695 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxd10P28359 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxd10P28359 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxd10P28359 Gm37287-201ENSMUST00000195449 695 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxd10P28359 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxd10P28359 Gm43380-201ENSMUST00000200421 220 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxd10P28359 Gm43912-201ENSMUST00000204352 538 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxd10P28359 Gm18706-201ENSMUST00000210053 1066 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxd10P28359 AC118639.2-201ENSMUST00000226289 223 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxd10P28359 Gm10263-201ENSMUST00000085163 300 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxd10P28359 Prss3-201ENSMUST00000096003 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxd10P28359 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxd10P28359 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxd10P28359 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxd10P28359 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
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