Protein–RNA interactions for Protein: P28310

Defa3, Alpha-defensin 3, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa3P28310 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Defa3P28310 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Defa3P28310 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Defa3P28310 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Defa3P28310 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Defa3P28310 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.05
Defa3P28310 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Defa3P28310 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Defa3P28310 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Defa3P28310 Rasgrp4-212ENSMUST00000204194 2993 ntTSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.05
Defa3P28310 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Defa3P28310 Tfap2b-204ENSMUST00000187754 3023 ntTSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Defa3P28310 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Defa3P28310 Itgad-201ENSMUST00000033051 3965 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Defa3P28310 Gm42602-201ENSMUST00000200288 3224 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
Defa3P28310 Clock-201ENSMUST00000075159 7478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Defa3P28310 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.05
Defa3P28310 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Defa3P28310 Tfr2-207ENSMUST00000198866 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Defa3P28310 Serac1-202ENSMUST00000097432 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Defa3P28310 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Defa3P28310 Gm45828-201ENSMUST00000206938 1836 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
Defa3P28310 Prrxl1-204ENSMUST00000189022 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Defa3P28310 Tnip1-206ENSMUST00000108889 2834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Defa3P28310 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Defa3P28310 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Defa3P28310 Msrb3-201ENSMUST00000092143 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Defa3P28310 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Defa3P28310 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Defa3P28310 Prdm10-204ENSMUST00000215499 6772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Defa3P28310 Megf11-202ENSMUST00000093829 3652 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Defa3P28310 Araf-201ENSMUST00000001155 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Defa3P28310 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Defa3P28310 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
Defa3P28310 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Defa3P28310 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Defa3P28310 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Defa3P28310 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Defa3P28310 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Defa3P28310 Gm15446-201ENSMUST00000112544 2417 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Defa3P28310 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Defa3P28310 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Defa3P28310 Ccnk-202ENSMUST00000221167 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Defa3P28310 Zfhx3-201ENSMUST00000043896 16433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Defa3P28310 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Defa3P28310 Ccdc33-201ENSMUST00000042205 2632 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Defa3P28310 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Defa3P28310 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Defa3P28310 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Defa3P28310 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
Defa3P28310 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Defa3P28310 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Defa3P28310 Sparc-202ENSMUST00000108858 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Defa3P28310 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Defa3P28310 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Defa3P28310 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
Defa3P28310 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Defa3P28310 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Defa3P28310 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Defa3P28310 Tanc1-208ENSMUST00000139863 7246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Defa3P28310 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Defa3P28310 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Defa3P28310 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
Defa3P28310 Crot-201ENSMUST00000003720 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Defa3P28310 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
Defa3P28310 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Defa3P28310 Celf1-205ENSMUST00000111449 4441 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Defa3P28310 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Defa3P28310 Pou6f1-201ENSMUST00000058274 2523 ntTSL 2 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Defa3P28310 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Defa3P28310 Tfip11-201ENSMUST00000031288 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Defa3P28310 Tfap2b-201ENSMUST00000027059 5863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Defa3P28310 Gm37969-201ENSMUST00000195777 3409 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
Defa3P28310 Ift88os-201ENSMUST00000149702 2016 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Defa3P28310 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Defa3P28310 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Defa3P28310 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Defa3P28310 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Defa3P28310 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Defa3P28310 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Defa3P28310 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Defa3P28310 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Defa3P28310 Tmc3-201ENSMUST00000039317 6221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Defa3P28310 Tex2-202ENSMUST00000103070 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Defa3P28310 Poldip3-202ENSMUST00000100375 3157 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Defa3P28310 Ano2-204ENSMUST00000160496 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Defa3P28310 Cacna1c-208ENSMUST00000187317 6663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
Defa3P28310 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Defa3P28310 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Defa3P28310 Ncapd3-202ENSMUST00000086198 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Defa3P28310 Ehmt1-210ENSMUST00000147147 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Defa3P28310 AC154171.2-201ENSMUST00000225219 2652 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
Defa3P28310 Il1r1-201ENSMUST00000027241 5819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Defa3P28310 Cacna1c-222ENSMUST00000190285 6585 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Defa3P28310 Kat6b-207ENSMUST00000182855 6791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Defa3P28310 Adamts4-203ENSMUST00000219033 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Defa3P28310 Dhx40-201ENSMUST00000018569 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Defa3P28310 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
Defa3P28310 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
Defa3P28310 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 200 ms