Protein–RNA interactions for Protein: P26618

Pdgfra, Platelet-derived growth factor receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfraP26618 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PdgfraP26618 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PdgfraP26618 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PdgfraP26618 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
PdgfraP26618 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
PdgfraP26618 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
PdgfraP26618 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PdgfraP26618 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PdgfraP26618 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PdgfraP26618 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
PdgfraP26618 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PdgfraP26618 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PdgfraP26618 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PdgfraP26618 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
PdgfraP26618 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PdgfraP26618 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PdgfraP26618 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PdgfraP26618 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
PdgfraP26618 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PdgfraP26618 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PdgfraP26618 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PdgfraP26618 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PdgfraP26618 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PdgfraP26618 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
PdgfraP26618 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
PdgfraP26618 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PdgfraP26618 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
PdgfraP26618 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PdgfraP26618 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PdgfraP26618 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
PdgfraP26618 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
PdgfraP26618 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
PdgfraP26618 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PdgfraP26618 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
PdgfraP26618 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
PdgfraP26618 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
PdgfraP26618 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
PdgfraP26618 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PdgfraP26618 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
PdgfraP26618 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PdgfraP26618 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
PdgfraP26618 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PdgfraP26618 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PdgfraP26618 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PdgfraP26618 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
PdgfraP26618 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PdgfraP26618 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PdgfraP26618 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PdgfraP26618 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PdgfraP26618 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PdgfraP26618 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PdgfraP26618 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
PdgfraP26618 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PdgfraP26618 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PdgfraP26618 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PdgfraP26618 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PdgfraP26618 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PdgfraP26618 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
PdgfraP26618 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
PdgfraP26618 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PdgfraP26618 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PdgfraP26618 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PdgfraP26618 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
PdgfraP26618 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
PdgfraP26618 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
PdgfraP26618 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
PdgfraP26618 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
PdgfraP26618 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
PdgfraP26618 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
PdgfraP26618 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
PdgfraP26618 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
PdgfraP26618 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
PdgfraP26618 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PdgfraP26618 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PdgfraP26618 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PdgfraP26618 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PdgfraP26618 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
PdgfraP26618 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PdgfraP26618 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PdgfraP26618 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
PdgfraP26618 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
PdgfraP26618 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
PdgfraP26618 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PdgfraP26618 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PdgfraP26618 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
PdgfraP26618 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PdgfraP26618 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
PdgfraP26618 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PdgfraP26618 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
PdgfraP26618 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PdgfraP26618 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PdgfraP26618 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PdgfraP26618 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PdgfraP26618 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PdgfraP26618 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PdgfraP26618 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PdgfraP26618 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PdgfraP26618 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PdgfraP26618 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PdgfraP26618 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms