Protein–RNA interactions for Protein: P25233

Ndn, Necdin, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NdnP25233 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
NdnP25233 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
NdnP25233 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC9.57□□□□□ -0.88
NdnP25233 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
NdnP25233 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC9.57□□□□□ -0.88
NdnP25233 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
NdnP25233 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC9.57□□□□□ -0.88
NdnP25233 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
NdnP25233 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
NdnP25233 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
NdnP25233 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
NdnP25233 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
NdnP25233 Atg2a-201ENSMUST00000045351 6371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
NdnP25233 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
NdnP25233 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
NdnP25233 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
NdnP25233 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
NdnP25233 Ptbp1-206ENSMUST00000165704 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
NdnP25233 Armcx3-203ENSMUST00000086884 3488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
NdnP25233 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC9.57□□□□□ -0.88
NdnP25233 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
NdnP25233 1810053B23Rik-205ENSMUST00000188056 1592 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
NdnP25233 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
NdnP25233 Qrfpr-203ENSMUST00000197447 1690 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
NdnP25233 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
NdnP25233 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
NdnP25233 Gpsm1-201ENSMUST00000066889 3432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
NdnP25233 Dcst2-201ENSMUST00000208216 2285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
NdnP25233 4930432K21Rik-202ENSMUST00000118856 2366 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
NdnP25233 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
NdnP25233 Tnip1-203ENSMUST00000102731 2973 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
NdnP25233 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
NdnP25233 Fos-201ENSMUST00000021674 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
NdnP25233 AC164092.1-201ENSMUST00000215635 2232 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
NdnP25233 Cux1-211ENSMUST00000176745 2831 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
NdnP25233 Marveld2-204ENSMUST00000225754 3111 ntAPPRIS P1 BASIC9.56□□□□□ -0.88
NdnP25233 Ube3a-203ENSMUST00000200758 9856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
NdnP25233 Mettl14-204ENSMUST00000174323 4202 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
NdnP25233 Atad5-201ENSMUST00000017694 7272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
NdnP25233 Rnpc3-201ENSMUST00000092154 3888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
NdnP25233 Zfp384-204ENSMUST00000088308 2875 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
NdnP25233 Gm29222-201ENSMUST00000185442 2167 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
NdnP25233 Gm29449-201ENSMUST00000187820 2168 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
NdnP25233 Gm28104-201ENSMUST00000188331 2168 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
NdnP25233 Gm28743-201ENSMUST00000189014 2168 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
NdnP25233 Gm29384-201ENSMUST00000190852 2168 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
NdnP25233 Gm37538-201ENSMUST00000192417 2168 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
NdnP25233 Slc38a5-202ENSMUST00000115590 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
NdnP25233 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
NdnP25233 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
NdnP25233 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
NdnP25233 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
NdnP25233 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
NdnP25233 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
NdnP25233 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
NdnP25233 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
NdnP25233 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
NdnP25233 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
NdnP25233 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
NdnP25233 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
NdnP25233 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
NdnP25233 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
NdnP25233 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
NdnP25233 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
NdnP25233 Pcdh11x-202ENSMUST00000113358 8607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
NdnP25233 D930020B18Rik-201ENSMUST00000120642 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
NdnP25233 Unc5cl-201ENSMUST00000074574 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
NdnP25233 Smarca2-201ENSMUST00000025862 5921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
NdnP25233 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
NdnP25233 Tsc22d4-202ENSMUST00000100539 3983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
NdnP25233 Gm11033-203ENSMUST00000156185 2321 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
NdnP25233 Riox2-202ENSMUST00000120667 2200 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
NdnP25233 Csf1r-202ENSMUST00000115268 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
NdnP25233 Dqx1-201ENSMUST00000077502 3257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
NdnP25233 Sema4g-201ENSMUST00000026225 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
NdnP25233 Rab27a-201ENSMUST00000034722 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
NdnP25233 Rangap1-201ENSMUST00000052374 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
NdnP25233 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
NdnP25233 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
NdnP25233 Elavl2-201ENSMUST00000008633 3730 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
NdnP25233 Uhrf1-202ENSMUST00000113035 3402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
NdnP25233 Arhgef10-202ENSMUST00000110800 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
NdnP25233 Hps4-202ENSMUST00000112359 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
NdnP25233 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
NdnP25233 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
NdnP25233 Eif2ak4-201ENSMUST00000005233 5212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
NdnP25233 Mllt3-201ENSMUST00000078090 6069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
NdnP25233 Slc17a5-201ENSMUST00000052441 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
NdnP25233 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
NdnP25233 Zfp780b-201ENSMUST00000081618 3004 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
NdnP25233 Klhl3-201ENSMUST00000091583 6871 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
NdnP25233 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
NdnP25233 Cfb-207ENSMUST00000176203 2733 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
NdnP25233 Ipo7-201ENSMUST00000084731 4763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
NdnP25233 Inf2-201ENSMUST00000101029 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
NdnP25233 Dhx34-207ENSMUST00000163968 3801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
NdnP25233 Dkk2-201ENSMUST00000029665 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
NdnP25233 Jmjd4-202ENSMUST00000108777 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
NdnP25233 Fdft1-201ENSMUST00000054963 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
NdnP25233 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms