Protein–RNA interactions for Protein: P21952

Pou3f1, POU domain, class 3, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou3f1P21952 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pou3f1P21952 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pou3f1P21952 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pou3f1P21952 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pou3f1P21952 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pou3f1P21952 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pou3f1P21952 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pou3f1P21952 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pou3f1P21952 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pou3f1P21952 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pou3f1P21952 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pou3f1P21952 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pou3f1P21952 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pou3f1P21952 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pou3f1P21952 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pou3f1P21952 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pou3f1P21952 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pou3f1P21952 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pou3f1P21952 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Pou3f1P21952 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pou3f1P21952 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pou3f1P21952 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pou3f1P21952 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pou3f1P21952 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Pou3f1P21952 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pou3f1P21952 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pou3f1P21952 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pou3f1P21952 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pou3f1P21952 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pou3f1P21952 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pou3f1P21952 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pou3f1P21952 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pou3f1P21952 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pou3f1P21952 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Pou3f1P21952 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pou3f1P21952 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Pou3f1P21952 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pou3f1P21952 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pou3f1P21952 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Pou3f1P21952 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pou3f1P21952 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pou3f1P21952 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Pou3f1P21952 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pou3f1P21952 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pou3f1P21952 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pou3f1P21952 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pou3f1P21952 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pou3f1P21952 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pou3f1P21952 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pou3f1P21952 Lepr-203ENSMUST00000106921 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pou3f1P21952 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pou3f1P21952 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pou3f1P21952 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pou3f1P21952 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pou3f1P21952 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pou3f1P21952 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pou3f1P21952 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pou3f1P21952 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pou3f1P21952 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pou3f1P21952 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pou3f1P21952 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pou3f1P21952 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pou3f1P21952 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pou3f1P21952 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pou3f1P21952 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pou3f1P21952 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pou3f1P21952 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pou3f1P21952 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pou3f1P21952 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pou3f1P21952 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pou3f1P21952 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Pou3f1P21952 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pou3f1P21952 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pou3f1P21952 AC127597.1-201ENSMUST00000225697 5711 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Pou3f1P21952 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pou3f1P21952 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pou3f1P21952 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pou3f1P21952 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pou3f1P21952 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pou3f1P21952 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pou3f1P21952 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pou3f1P21952 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pou3f1P21952 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pou3f1P21952 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pou3f1P21952 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Pou3f1P21952 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Pou3f1P21952 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Pou3f1P21952 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Pou3f1P21952 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pou3f1P21952 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pou3f1P21952 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pou3f1P21952 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pou3f1P21952 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pou3f1P21952 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pou3f1P21952 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Pou3f1P21952 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pou3f1P21952 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pou3f1P21952 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pou3f1P21952 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pou3f1P21952 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.8 ms