Protein–RNA interactions for Protein: P20664

Prim1, DNA primase small subunit, mousemouse

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Length 417 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prim1P20664 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prim1P20664 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prim1P20664 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prim1P20664 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Prim1P20664 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prim1P20664 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prim1P20664 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prim1P20664 A530046M15Rik-201ENSMUST00000221778 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prim1P20664 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prim1P20664 Mapkapk5-203ENSMUST00000111782 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prim1P20664 D6Ertd474e-203ENSMUST00000160188 683 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prim1P20664 Gm9550-201ENSMUST00000161130 862 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Prim1P20664 Gm20535-201ENSMUST00000173157 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prim1P20664 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prim1P20664 Dusp13-211ENSMUST00000183943 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prim1P20664 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prim1P20664 Mir7686-201ENSMUST00000200604 57 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Prim1P20664 Gm43811-201ENSMUST00000202862 695 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Prim1P20664 Gm45151-201ENSMUST00000205445 712 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prim1P20664 Gng8-204ENSMUST00000205716 432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prim1P20664 Gm7238-201ENSMUST00000206467 973 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Prim1P20664 AC162938.2-204ENSMUST00000216455 984 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prim1P20664 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Prim1P20664 Olfr1466-201ENSMUST00000075868 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prim1P20664 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prim1P20664 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prim1P20664 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prim1P20664 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prim1P20664 Gm21998-201ENSMUST00000117552 1308 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Prim1P20664 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prim1P20664 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prim1P20664 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prim1P20664 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prim1P20664 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prim1P20664 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prim1P20664 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prim1P20664 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prim1P20664 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Prim1P20664 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prim1P20664 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prim1P20664 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prim1P20664 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prim1P20664 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prim1P20664 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prim1P20664 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prim1P20664 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prim1P20664 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prim1P20664 Mir706-201ENSMUST00000102262 84 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Prim1P20664 Eloc-201ENSMUST00000115352 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prim1P20664 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Prim1P20664 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prim1P20664 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prim1P20664 2810049E08Rik-201ENSMUST00000185600 1102 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prim1P20664 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Prim1P20664 Gm43400-201ENSMUST00000197294 1254 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prim1P20664 Gm4797-201ENSMUST00000219075 1283 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Prim1P20664 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Prim1P20664 Rln1-201ENSMUST00000044143 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prim1P20664 Tas2r126-201ENSMUST00000059534 930 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prim1P20664 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prim1P20664 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prim1P20664 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prim1P20664 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prim1P20664 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prim1P20664 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prim1P20664 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prim1P20664 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prim1P20664 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Prim1P20664 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prim1P20664 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prim1P20664 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Prim1P20664 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Prim1P20664 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Prim1P20664 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Prim1P20664 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Prim1P20664 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Prim1P20664 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Prim1P20664 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Prim1P20664 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prim1P20664 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prim1P20664 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prim1P20664 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prim1P20664 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prim1P20664 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prim1P20664 Gm24541-201ENSMUST00000103871 96 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Prim1P20664 Cd300ld2-202ENSMUST00000106578 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prim1P20664 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Prim1P20664 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prim1P20664 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prim1P20664 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prim1P20664 Ccser2-208ENSMUST00000183007 1293 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prim1P20664 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Prim1P20664 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Prim1P20664 4930430O22Rik-202ENSMUST00000202548 579 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Prim1P20664 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prim1P20664 Gm44126-201ENSMUST00000204831 514 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Prim1P20664 4930595O18Rik-201ENSMUST00000205099 607 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Prim1P20664 Gm7395-201ENSMUST00000216059 1045 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Prim1P20664 Gm18556-201ENSMUST00000219748 1031 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Prim1P20664 Gm29787-201ENSMUST00000222129 849 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.4 ms