Protein–RNA interactions for Protein: P18529

Ig heavy chain V region 5-76, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18529 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
P18529 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
P18529 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
P18529 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
P18529 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
P18529 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
P18529 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
P18529 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
P18529 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
P18529 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
P18529 Pdzd7-203ENSMUST00000169459 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
P18529 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
P18529 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
P18529 Pias2-203ENSMUST00000168882 4984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
P18529 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
P18529 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
P18529 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
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P18529 Trim25-201ENSMUST00000000284 5566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
P18529 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
P18529 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
P18529 Kalrn-207ENSMUST00000114960 6452 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
P18529 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
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P18529 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
P18529 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
P18529 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
P18529 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
P18529 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
P18529 Plin4-202ENSMUST00000190703 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
P18529 Jmjd4-202ENSMUST00000108777 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
P18529 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
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P18529 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
P18529 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
P18529 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
P18529 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
P18529 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
P18529 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
P18529 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
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P18529 Slc6a2-202ENSMUST00000165470 6007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
P18529 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
P18529 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
P18529 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
P18529 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
P18529 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
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P18529 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
P18529 Myh10-203ENSMUST00000102611 7791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
P18529 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
P18529 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
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P18529 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
P18529 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
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P18529 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
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P18529 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
P18529 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
P18529 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
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P18529 Cbl-211ENSMUST00000206720 11372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
P18529 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
P18529 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC9.84□□□□□ -0.83
P18529 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
P18529 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
P18529 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
P18529 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
P18529 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
P18529 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
P18529 Kbtbd12-202ENSMUST00000120933 4644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
P18529 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
P18529 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
P18529 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
P18529 Adgrl3-201ENSMUST00000036068 6203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
P18529 Adgrl3-202ENSMUST00000072521 6203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
P18529 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
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