Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
P10404 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
P10404 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
P10404 B430010I23Rik-202ENSMUST00000152188 1168 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
P10404 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
P10404 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
P10404 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
P10404 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
P10404 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
P10404 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
P10404 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
P10404 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
P10404 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
P10404 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
P10404 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
P10404 Gm18363-201ENSMUST00000221671 730 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
P10404 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
P10404 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
P10404 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
P10404 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
P10404 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
P10404 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
P10404 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
P10404 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
P10404 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
P10404 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
P10404 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
P10404 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
P10404 Dopey2-207ENSMUST00000227156 7340 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
P10404 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
P10404 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
P10404 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
P10404 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
P10404 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
P10404 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
P10404 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
P10404 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
P10404 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
P10404 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
P10404 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
P10404 Tmod2-201ENSMUST00000064433 9884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
P10404 Atg10-201ENSMUST00000022119 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
P10404 Otof-202ENSMUST00000114747 6881 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
P10404 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
P10404 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
P10404 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
P10404 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
P10404 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
P10404 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
P10404 Bmp3-203ENSMUST00000200388 6609 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
P10404 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
P10404 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
P10404 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
P10404 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
P10404 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
P10404 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
P10404 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
P10404 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
P10404 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
P10404 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
P10404 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
P10404 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
P10404 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
P10404 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
P10404 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
P10404 AC159246.1-201ENSMUST00000214478 249 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
P10404 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
P10404 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
P10404 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
P10404 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
P10404 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
P10404 Gm10271-201ENSMUST00000092165 156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
P10404 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
P10404 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
P10404 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
P10404 Plcd4-205ENSMUST00000113749 4648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
P10404 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
P10404 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
P10404 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
P10404 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
P10404 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
P10404 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
P10404 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
P10404 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
P10404 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
P10404 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
P10404 Abcc10-202ENSMUST00000095261 5266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
P10404 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
P10404 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
P10404 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
P10404 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
P10404 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
P10404 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
P10404 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
P10404 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
P10404 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
P10404 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
P10404 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
P10404 Gm43860-201ENSMUST00000201742 2705 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
P10404 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms