Protein–RNA interactions for Protein: P04187

Gzmb, Granzyme B(G,H), mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GzmbP04187 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
GzmbP04187 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
GzmbP04187 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
GzmbP04187 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
GzmbP04187 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
GzmbP04187 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
GzmbP04187 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
GzmbP04187 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
GzmbP04187 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
GzmbP04187 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
GzmbP04187 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
GzmbP04187 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
GzmbP04187 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
GzmbP04187 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
GzmbP04187 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
GzmbP04187 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
GzmbP04187 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
GzmbP04187 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
GzmbP04187 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
GzmbP04187 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
GzmbP04187 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
GzmbP04187 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
GzmbP04187 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
GzmbP04187 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
GzmbP04187 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
GzmbP04187 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
GzmbP04187 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
GzmbP04187 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
GzmbP04187 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
GzmbP04187 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
GzmbP04187 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
GzmbP04187 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
GzmbP04187 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
GzmbP04187 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
GzmbP04187 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
GzmbP04187 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
GzmbP04187 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
GzmbP04187 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
GzmbP04187 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
GzmbP04187 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
GzmbP04187 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
GzmbP04187 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
GzmbP04187 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
GzmbP04187 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
GzmbP04187 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
GzmbP04187 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
GzmbP04187 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
GzmbP04187 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
GzmbP04187 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
GzmbP04187 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
GzmbP04187 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
GzmbP04187 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
GzmbP04187 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
GzmbP04187 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
GzmbP04187 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
GzmbP04187 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
GzmbP04187 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
GzmbP04187 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
GzmbP04187 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
GzmbP04187 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
GzmbP04187 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
GzmbP04187 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
GzmbP04187 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
GzmbP04187 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
GzmbP04187 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
GzmbP04187 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
GzmbP04187 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
GzmbP04187 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
GzmbP04187 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
GzmbP04187 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
GzmbP04187 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
GzmbP04187 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
GzmbP04187 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
GzmbP04187 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
GzmbP04187 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
GzmbP04187 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
GzmbP04187 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
GzmbP04187 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
GzmbP04187 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
GzmbP04187 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
GzmbP04187 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
GzmbP04187 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
GzmbP04187 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
GzmbP04187 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
GzmbP04187 Aldh3a1-202ENSMUST00000108716 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
GzmbP04187 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
GzmbP04187 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
GzmbP04187 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
GzmbP04187 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
GzmbP04187 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
GzmbP04187 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
GzmbP04187 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
GzmbP04187 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
GzmbP04187 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
GzmbP04187 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
GzmbP04187 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
GzmbP04187 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
GzmbP04187 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
GzmbP04187 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
GzmbP04187 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 936.1 ms