Protein–RNA interactions for Protein: P01662

Ig kappa chain V-III region ABPC 22/PC 9245, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01662 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01662 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01662 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01662 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01662 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01662 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01662 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01662 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
P01662 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01662 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01662 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
P01662 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01662 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01662 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01662 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01662 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01662 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01662 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01662 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01662 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01662 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01662 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01662 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01662 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01662 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
P01662 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01662 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01662 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01662 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01662 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01662 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01662 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01662 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01662 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01662 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01662 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01662 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01662 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01662 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01662 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01662 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01662 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
P01662 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
P01662 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
P01662 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
P01662 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
P01662 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
P01662 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
P01662 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
P01662 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
P01662 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
P01662 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01662 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
P01662 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
P01662 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01662 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
P01662 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01662 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
P01662 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01662 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01662 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
P01662 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01662 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01662 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01662 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01662 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01662 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01662 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01662 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01662 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01662 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01662 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01662 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01662 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P01662 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P01662 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P01662 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
P01662 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P01662 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P01662 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P01662 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P01662 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
P01662 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P01662 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
P01662 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
P01662 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P01662 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P01662 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P01662 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P01662 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
P01662 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P01662 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
P01662 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P01662 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
P01662 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
P01662 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P01662 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P01662 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P01662 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
P01662 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms