Protein–RNA interactions for Protein: O88874

Ccnk, Cyclin-K, mousemouse

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Length 554 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcnkO88874 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
CcnkO88874 Map4-203ENSMUST00000163979 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
CcnkO88874 Brd1-202ENSMUST00000109380 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
CcnkO88874 Spg20-203ENSMUST00000117341 2957 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
CcnkO88874 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
CcnkO88874 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
CcnkO88874 Olfr582-202ENSMUST00000210119 1787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
CcnkO88874 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
CcnkO88874 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
CcnkO88874 Usp44-201ENSMUST00000095333 2946 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
CcnkO88874 Tyw1-202ENSMUST00000044204 4698 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
CcnkO88874 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
CcnkO88874 Ttll7-205ENSMUST00000170055 6075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
CcnkO88874 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
CcnkO88874 AC164099.2-201ENSMUST00000227795 2005 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
CcnkO88874 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
CcnkO88874 Wipf1-203ENSMUST00000102680 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
CcnkO88874 Eng-201ENSMUST00000009705 3422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
CcnkO88874 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
CcnkO88874 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
CcnkO88874 AC129336.2-201ENSMUST00000218053 3086 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
CcnkO88874 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
CcnkO88874 Polr3e-201ENSMUST00000033173 4194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
CcnkO88874 Olfr742-203ENSMUST00000217437 2244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
CcnkO88874 Ets2-201ENSMUST00000023612 3890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
CcnkO88874 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
CcnkO88874 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
CcnkO88874 Tm9sf1-202ENSMUST00000120041 2164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
CcnkO88874 Sell-201ENSMUST00000027871 2199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
CcnkO88874 Gphb5-201ENSMUST00000051079 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
CcnkO88874 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
CcnkO88874 Neu2-206ENSMUST00000166259 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
CcnkO88874 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
CcnkO88874 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
CcnkO88874 1110051M20Rik-201ENSMUST00000064652 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
CcnkO88874 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
CcnkO88874 Med19-201ENSMUST00000102645 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
CcnkO88874 Myo15b-201ENSMUST00000040703 2825 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
CcnkO88874 Cacna1s-204ENSMUST00000160641 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
CcnkO88874 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
CcnkO88874 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
CcnkO88874 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
CcnkO88874 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
CcnkO88874 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
CcnkO88874 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
CcnkO88874 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
CcnkO88874 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
CcnkO88874 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
CcnkO88874 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
CcnkO88874 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
CcnkO88874 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
CcnkO88874 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
CcnkO88874 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
CcnkO88874 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
CcnkO88874 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
CcnkO88874 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
CcnkO88874 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
CcnkO88874 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
CcnkO88874 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
CcnkO88874 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
CcnkO88874 Gm26737-201ENSMUST00000181106 2151 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
CcnkO88874 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
CcnkO88874 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
CcnkO88874 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
CcnkO88874 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
CcnkO88874 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
CcnkO88874 Pcdhgb4-202ENSMUST00000195363 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
CcnkO88874 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
CcnkO88874 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
CcnkO88874 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CcnkO88874 Ncdn-201ENSMUST00000030637 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CcnkO88874 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CcnkO88874 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
CcnkO88874 Tmem92-201ENSMUST00000100554 2043 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CcnkO88874 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CcnkO88874 Kcnh3-201ENSMUST00000041415 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CcnkO88874 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
CcnkO88874 4732490B19Rik-201ENSMUST00000130373 2446 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CcnkO88874 Fhdc1-201ENSMUST00000091002 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CcnkO88874 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CcnkO88874 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
CcnkO88874 Gripap1-203ENSMUST00000115675 3015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CcnkO88874 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CcnkO88874 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CcnkO88874 Zbtb21-203ENSMUST00000113734 6010 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
CcnkO88874 Caprin1-202ENSMUST00000111147 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CcnkO88874 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CcnkO88874 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CcnkO88874 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
CcnkO88874 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
CcnkO88874 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
CcnkO88874 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
CcnkO88874 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CcnkO88874 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
CcnkO88874 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CcnkO88874 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
CcnkO88874 Raph1-204ENSMUST00000140485 10024 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
CcnkO88874 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
CcnkO88874 Qsox1-201ENSMUST00000035325 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CcnkO88874 Cit-202ENSMUST00000102560 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
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