Protein–RNA interactions for Protein: O55028

Bckdk, [3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase [lipoamide]] kinase, mitochondrial, mousemouse

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Length 412 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BckdkO55028 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
BckdkO55028 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
BckdkO55028 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
BckdkO55028 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
BckdkO55028 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
BckdkO55028 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
BckdkO55028 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
BckdkO55028 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
BckdkO55028 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
BckdkO55028 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
BckdkO55028 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
BckdkO55028 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
BckdkO55028 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
BckdkO55028 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
BckdkO55028 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
BckdkO55028 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
BckdkO55028 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
BckdkO55028 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
BckdkO55028 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
BckdkO55028 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
BckdkO55028 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
BckdkO55028 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
BckdkO55028 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
BckdkO55028 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
BckdkO55028 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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BckdkO55028 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
BckdkO55028 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
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BckdkO55028 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
BckdkO55028 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
BckdkO55028 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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BckdkO55028 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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BckdkO55028 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
BckdkO55028 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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BckdkO55028 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
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BckdkO55028 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
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BckdkO55028 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
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BckdkO55028 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
BckdkO55028 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
BckdkO55028 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
BckdkO55028 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
BckdkO55028 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
BckdkO55028 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
BckdkO55028 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
BckdkO55028 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
BckdkO55028 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
BckdkO55028 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
BckdkO55028 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
BckdkO55028 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
BckdkO55028 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
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BckdkO55028 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
BckdkO55028 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
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BckdkO55028 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
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