Protein–RNA interactions for Protein: O35927

Ctnnd2, Catenin delta-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnd2O35927 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ctnnd2O35927 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Ctnnd2O35927 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ctnnd2O35927 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ctnnd2O35927 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ctnnd2O35927 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ctnnd2O35927 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ctnnd2O35927 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ctnnd2O35927 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ctnnd2O35927 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ctnnd2O35927 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ctnnd2O35927 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ctnnd2O35927 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ctnnd2O35927 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ctnnd2O35927 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ctnnd2O35927 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ctnnd2O35927 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ctnnd2O35927 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ctnnd2O35927 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ctnnd2O35927 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ctnnd2O35927 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Ctnnd2O35927 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ctnnd2O35927 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ctnnd2O35927 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ctnnd2O35927 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ctnnd2O35927 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ctnnd2O35927 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Ctnnd2O35927 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ctnnd2O35927 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Ctnnd2O35927 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ctnnd2O35927 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ctnnd2O35927 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ctnnd2O35927 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ctnnd2O35927 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ctnnd2O35927 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ctnnd2O35927 Slc6a5-201ENSMUST00000056442 7065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ctnnd2O35927 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ctnnd2O35927 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ctnnd2O35927 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ctnnd2O35927 Rab14-202ENSMUST00000113025 4346 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ctnnd2O35927 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ctnnd2O35927 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ctnnd2O35927 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ctnnd2O35927 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Ctnnd2O35927 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ctnnd2O35927 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ctnnd2O35927 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ctnnd2O35927 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ctnnd2O35927 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ctnnd2O35927 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ctnnd2O35927 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ctnnd2O35927 Slc6a2-202ENSMUST00000165470 6007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ctnnd2O35927 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ctnnd2O35927 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ctnnd2O35927 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ctnnd2O35927 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ctnnd2O35927 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ctnnd2O35927 Slc45a4-201ENSMUST00000054266 4664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ctnnd2O35927 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ctnnd2O35927 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ctnnd2O35927 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ctnnd2O35927 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ctnnd2O35927 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ctnnd2O35927 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ctnnd2O35927 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ctnnd2O35927 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ctnnd2O35927 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ctnnd2O35927 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Ctnnd2O35927 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ctnnd2O35927 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ctnnd2O35927 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ctnnd2O35927 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ctnnd2O35927 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ctnnd2O35927 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ctnnd2O35927 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ctnnd2O35927 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ctnnd2O35927 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ctnnd2O35927 Kalrn-207ENSMUST00000114960 6452 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ctnnd2O35927 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ctnnd2O35927 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ctnnd2O35927 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ctnnd2O35927 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ctnnd2O35927 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ctnnd2O35927 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ctnnd2O35927 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ctnnd2O35927 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ctnnd2O35927 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ctnnd2O35927 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ctnnd2O35927 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ctnnd2O35927 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ctnnd2O35927 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ctnnd2O35927 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ctnnd2O35927 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ctnnd2O35927 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ctnnd2O35927 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Ctnnd2O35927 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ctnnd2O35927 Dsc2-201ENSMUST00000039247 4630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ctnnd2O35927 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ctnnd2O35927 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.8 ms