Protein–RNA interactions for Protein: O35599

Opn1mw, Medium-wave-sensitive opsin 1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn1mwO35599 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Opn1mwO35599 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Opn1mwO35599 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Opn1mwO35599 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Opn1mwO35599 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Opn1mwO35599 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Opn1mwO35599 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Opn1mwO35599 Ywhaq-ps2-201ENSMUST00000117738 643 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Opn1mwO35599 Gm14942-201ENSMUST00000119642 336 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Opn1mwO35599 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Opn1mwO35599 Gm28037-201ENSMUST00000122365 611 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Opn1mwO35599 Gm13091-201ENSMUST00000128800 469 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Opn1mwO35599 Gm14236-201ENSMUST00000142374 872 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Opn1mwO35599 Gm23218-201ENSMUST00000158124 276 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Opn1mwO35599 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Opn1mwO35599 Elof1-202ENSMUST00000166335 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Opn1mwO35599 Gm22877-201ENSMUST00000175451 105 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Opn1mwO35599 Eef1b2-209ENSMUST00000188524 681 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Opn1mwO35599 2310074N15Rik-201ENSMUST00000198276 582 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Opn1mwO35599 Gm5298-201ENSMUST00000201122 892 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Opn1mwO35599 Gm35549-202ENSMUST00000203656 1009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Opn1mwO35599 Gm44158-201ENSMUST00000203881 505 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Opn1mwO35599 Sdf2-201ENSMUST00000002133 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Opn1mwO35599 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Opn1mwO35599 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Opn1mwO35599 CT009536.2-201ENSMUST00000225370 665 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Opn1mwO35599 AC102368.1-201ENSMUST00000227161 892 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Opn1mwO35599 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Opn1mwO35599 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Opn1mwO35599 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Opn1mwO35599 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Opn1mwO35599 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Opn1mwO35599 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Opn1mwO35599 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Opn1mwO35599 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Opn1mwO35599 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Opn1mwO35599 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Opn1mwO35599 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Opn1mwO35599 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Opn1mwO35599 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Opn1mwO35599 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Opn1mwO35599 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Opn1mwO35599 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Opn1mwO35599 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Opn1mwO35599 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Opn1mwO35599 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Opn1mwO35599 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Opn1mwO35599 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Opn1mwO35599 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Opn1mwO35599 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Opn1mwO35599 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Opn1mwO35599 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Opn1mwO35599 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Opn1mwO35599 Prss47-202ENSMUST00000203968 1353 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Opn1mwO35599 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Opn1mwO35599 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
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Opn1mwO35599 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Opn1mwO35599 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Opn1mwO35599 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Opn1mwO35599 Gm26783-201ENSMUST00000181197 2377 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Opn1mwO35599 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Opn1mwO35599 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Opn1mwO35599 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Opn1mwO35599 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
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Opn1mwO35599 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Opn1mwO35599 Gm37406-201ENSMUST00000192478 500 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
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Opn1mwO35599 Pmvk-204ENSMUST00000198440 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
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Opn1mwO35599 Taar9-201ENSMUST00000041180 1047 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Opn1mwO35599 Gm10135-201ENSMUST00000043711 252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Opn1mwO35599 Krtap4-2-201ENSMUST00000058987 974 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Opn1mwO35599 Krtap6-2-201ENSMUST00000082065 786 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Opn1mwO35599 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Opn1mwO35599 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Opn1mwO35599 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Opn1mwO35599 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Opn1mwO35599 Slc10a1-203ENSMUST00000218342 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Opn1mwO35599 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Opn1mwO35599 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Opn1mwO35599 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Opn1mwO35599 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Opn1mwO35599 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Opn1mwO35599 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Opn1mwO35599 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Opn1mwO35599 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Opn1mwO35599 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Opn1mwO35599 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Opn1mwO35599 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Opn1mwO35599 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Opn1mwO35599 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Opn1mwO35599 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Opn1mwO35599 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Opn1mwO35599 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Opn1mwO35599 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Opn1mwO35599 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Opn1mwO35599 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Opn1mwO35599 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
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