Protein–RNA interactions for Protein: L7N257

BC117090, cDNA sequence BC1179090, mousemouse

Predictions only

Length 96 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC117090L7N257 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
BC117090L7N257 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
BC117090L7N257 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
BC117090L7N257 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
BC117090L7N257 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
BC117090L7N257 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
BC117090L7N257 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
BC117090L7N257 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
BC117090L7N257 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
BC117090L7N257 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
BC117090L7N257 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
BC117090L7N257 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
BC117090L7N257 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
BC117090L7N257 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
BC117090L7N257 Tcof1-204ENSMUST00000176630 4529 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
BC117090L7N257 Slc9a8-201ENSMUST00000047815 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
BC117090L7N257 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
BC117090L7N257 Ric8a-201ENSMUST00000026558 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
BC117090L7N257 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
BC117090L7N257 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
BC117090L7N257 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
BC117090L7N257 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
BC117090L7N257 Scyl2-204ENSMUST00000174252 4817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
BC117090L7N257 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
BC117090L7N257 Ciita-201ENSMUST00000023147 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
BC117090L7N257 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
BC117090L7N257 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
BC117090L7N257 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
BC117090L7N257 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
BC117090L7N257 Vwa5b2-207ENSMUST00000159780 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
BC117090L7N257 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
BC117090L7N257 9030624J02Rik-202ENSMUST00000059390 5097 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
BC117090L7N257 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
BC117090L7N257 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
BC117090L7N257 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
BC117090L7N257 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
BC117090L7N257 AC123738.2-201ENSMUST00000223791 1899 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
BC117090L7N257 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
BC117090L7N257 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
BC117090L7N257 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
BC117090L7N257 Jade1-201ENSMUST00000026865 5481 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
BC117090L7N257 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
BC117090L7N257 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
BC117090L7N257 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
BC117090L7N257 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
BC117090L7N257 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
BC117090L7N257 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
BC117090L7N257 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
BC117090L7N257 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
BC117090L7N257 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
BC117090L7N257 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
BC117090L7N257 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
BC117090L7N257 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
BC117090L7N257 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
BC117090L7N257 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
BC117090L7N257 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
BC117090L7N257 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
BC117090L7N257 Tcf4-240ENSMUST00000201781 2779 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
BC117090L7N257 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
BC117090L7N257 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
BC117090L7N257 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
BC117090L7N257 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
BC117090L7N257 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
BC117090L7N257 Per1-202ENSMUST00000101004 3507 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
BC117090L7N257 Ikbkb-202ENSMUST00000063401 3977 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
BC117090L7N257 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
BC117090L7N257 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
BC117090L7N257 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
BC117090L7N257 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
BC117090L7N257 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
BC117090L7N257 Gpr101-201ENSMUST00000057645 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
BC117090L7N257 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
BC117090L7N257 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
BC117090L7N257 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
BC117090L7N257 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
BC117090L7N257 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
BC117090L7N257 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
BC117090L7N257 Scn10a-204ENSMUST00000214408 5877 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
BC117090L7N257 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
BC117090L7N257 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
BC117090L7N257 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
BC117090L7N257 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
BC117090L7N257 Pik3r5-201ENSMUST00000021283 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
BC117090L7N257 Arid2-201ENSMUST00000096250 8507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
BC117090L7N257 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
BC117090L7N257 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
BC117090L7N257 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
BC117090L7N257 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
BC117090L7N257 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
BC117090L7N257 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
BC117090L7N257 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
BC117090L7N257 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
BC117090L7N257 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
BC117090L7N257 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
BC117090L7N257 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
BC117090L7N257 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
BC117090L7N257 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
BC117090L7N257 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
BC117090L7N257 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
BC117090L7N257 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms