Protein–RNA interactions for Protein: J3QPX5

Gm8888, Predicted gene 8888, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8888J3QPX5 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm8888J3QPX5 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm8888J3QPX5 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm8888J3QPX5 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm8888J3QPX5 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm8888J3QPX5 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm8888J3QPX5 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm8888J3QPX5 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm8888J3QPX5 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm8888J3QPX5 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm8888J3QPX5 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm8888J3QPX5 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm8888J3QPX5 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm8888J3QPX5 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm8888J3QPX5 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm8888J3QPX5 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm8888J3QPX5 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm8888J3QPX5 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm8888J3QPX5 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm8888J3QPX5 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm8888J3QPX5 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm8888J3QPX5 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm8888J3QPX5 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm8888J3QPX5 Fam120b-201ENSMUST00000055352 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm8888J3QPX5 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm8888J3QPX5 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm8888J3QPX5 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm8888J3QPX5 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm8888J3QPX5 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm8888J3QPX5 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm8888J3QPX5 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm8888J3QPX5 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm8888J3QPX5 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm8888J3QPX5 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm8888J3QPX5 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm8888J3QPX5 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm8888J3QPX5 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm8888J3QPX5 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm8888J3QPX5 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm8888J3QPX5 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm8888J3QPX5 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm8888J3QPX5 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm8888J3QPX5 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm8888J3QPX5 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm8888J3QPX5 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm8888J3QPX5 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm8888J3QPX5 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm8888J3QPX5 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm8888J3QPX5 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm8888J3QPX5 Arnt2-213ENSMUST00000209133 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm8888J3QPX5 Otof-202ENSMUST00000114747 6881 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm8888J3QPX5 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm8888J3QPX5 Iqsec1-201ENSMUST00000101151 6490 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm8888J3QPX5 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm8888J3QPX5 Metap2-201ENSMUST00000047910 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm8888J3QPX5 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm8888J3QPX5 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm8888J3QPX5 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm8888J3QPX5 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm8888J3QPX5 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm8888J3QPX5 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm8888J3QPX5 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm8888J3QPX5 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm8888J3QPX5 Slc6a5-201ENSMUST00000056442 7065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm8888J3QPX5 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm8888J3QPX5 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm8888J3QPX5 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm8888J3QPX5 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm8888J3QPX5 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm8888J3QPX5 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm8888J3QPX5 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm8888J3QPX5 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm8888J3QPX5 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm8888J3QPX5 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm8888J3QPX5 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm8888J3QPX5 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm8888J3QPX5 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm8888J3QPX5 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm8888J3QPX5 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm8888J3QPX5 Gabra1-201ENSMUST00000020707 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm8888J3QPX5 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm8888J3QPX5 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm8888J3QPX5 Csnk1g1-202ENSMUST00000117849 5173 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm8888J3QPX5 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm8888J3QPX5 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm8888J3QPX5 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm8888J3QPX5 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm8888J3QPX5 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm8888J3QPX5 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm8888J3QPX5 Rab14-202ENSMUST00000113025 4346 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm8888J3QPX5 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm8888J3QPX5 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm8888J3QPX5 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm8888J3QPX5 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm8888J3QPX5 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm8888J3QPX5 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm8888J3QPX5 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm8888J3QPX5 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm8888J3QPX5 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm8888J3QPX5 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms