Protein–RNA interactions for Protein: J3QM72

Gm20834, Predicted gene, 20834, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20834J3QM72 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm20834J3QM72 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm20834J3QM72 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm20834J3QM72 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm20834J3QM72 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm20834J3QM72 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm20834J3QM72 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm20834J3QM72 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm20834J3QM72 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm20834J3QM72 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm20834J3QM72 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm20834J3QM72 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm20834J3QM72 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm20834J3QM72 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm20834J3QM72 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm20834J3QM72 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm20834J3QM72 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm20834J3QM72 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm20834J3QM72 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm20834J3QM72 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm20834J3QM72 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm20834J3QM72 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm20834J3QM72 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm20834J3QM72 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm20834J3QM72 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm20834J3QM72 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm20834J3QM72 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm20834J3QM72 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm20834J3QM72 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm20834J3QM72 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm20834J3QM72 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm20834J3QM72 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm20834J3QM72 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm20834J3QM72 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm20834J3QM72 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm20834J3QM72 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm20834J3QM72 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm20834J3QM72 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm20834J3QM72 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm20834J3QM72 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm20834J3QM72 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm20834J3QM72 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm20834J3QM72 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm20834J3QM72 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm20834J3QM72 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm20834J3QM72 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm20834J3QM72 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm20834J3QM72 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm20834J3QM72 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm20834J3QM72 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm20834J3QM72 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm20834J3QM72 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm20834J3QM72 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Gm20834J3QM72 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Gm20834J3QM72 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Gm20834J3QM72 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Gm20834J3QM72 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Gm20834J3QM72 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm20834J3QM72 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm20834J3QM72 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm20834J3QM72 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm20834J3QM72 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm20834J3QM72 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm20834J3QM72 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm20834J3QM72 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm20834J3QM72 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm20834J3QM72 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm20834J3QM72 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm20834J3QM72 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm20834J3QM72 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm20834J3QM72 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm20834J3QM72 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm20834J3QM72 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm20834J3QM72 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm20834J3QM72 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm20834J3QM72 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm20834J3QM72 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm20834J3QM72 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm20834J3QM72 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm20834J3QM72 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm20834J3QM72 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm20834J3QM72 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm20834J3QM72 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm20834J3QM72 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm20834J3QM72 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm20834J3QM72 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm20834J3QM72 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm20834J3QM72 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm20834J3QM72 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm20834J3QM72 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm20834J3QM72 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm20834J3QM72 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm20834J3QM72 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm20834J3QM72 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm20834J3QM72 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm20834J3QM72 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm20834J3QM72 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm20834J3QM72 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm20834J3QM72 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm20834J3QM72 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.7 ms