Protein–RNA interactions for Protein: H3BIW7

Gm29394, Predicted gene 29394, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm29394H3BIW7 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm29394H3BIW7 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm29394H3BIW7 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm29394H3BIW7 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm29394H3BIW7 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm29394H3BIW7 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm29394H3BIW7 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm29394H3BIW7 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm29394H3BIW7 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm29394H3BIW7 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm29394H3BIW7 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm29394H3BIW7 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm29394H3BIW7 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm29394H3BIW7 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm29394H3BIW7 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm29394H3BIW7 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm29394H3BIW7 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm29394H3BIW7 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm29394H3BIW7 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm29394H3BIW7 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm29394H3BIW7 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm29394H3BIW7 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm29394H3BIW7 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm29394H3BIW7 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm29394H3BIW7 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm29394H3BIW7 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm29394H3BIW7 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm29394H3BIW7 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm29394H3BIW7 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm29394H3BIW7 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm29394H3BIW7 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm29394H3BIW7 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm29394H3BIW7 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm29394H3BIW7 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm29394H3BIW7 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm29394H3BIW7 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm29394H3BIW7 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm29394H3BIW7 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm29394H3BIW7 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm29394H3BIW7 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm29394H3BIW7 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm29394H3BIW7 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm29394H3BIW7 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm29394H3BIW7 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm29394H3BIW7 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm29394H3BIW7 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm29394H3BIW7 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm29394H3BIW7 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm29394H3BIW7 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm29394H3BIW7 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm29394H3BIW7 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm29394H3BIW7 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm29394H3BIW7 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm29394H3BIW7 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm29394H3BIW7 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm29394H3BIW7 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm29394H3BIW7 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm29394H3BIW7 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm29394H3BIW7 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm29394H3BIW7 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm29394H3BIW7 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm29394H3BIW7 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm29394H3BIW7 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm29394H3BIW7 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm29394H3BIW7 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm29394H3BIW7 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm29394H3BIW7 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm29394H3BIW7 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm29394H3BIW7 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm29394H3BIW7 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm29394H3BIW7 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm29394H3BIW7 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm29394H3BIW7 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm29394H3BIW7 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm29394H3BIW7 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm29394H3BIW7 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm29394H3BIW7 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm29394H3BIW7 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm29394H3BIW7 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm29394H3BIW7 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm29394H3BIW7 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm29394H3BIW7 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm29394H3BIW7 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm29394H3BIW7 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm29394H3BIW7 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm29394H3BIW7 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm29394H3BIW7 AC127597.1-201ENSMUST00000225697 5711 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm29394H3BIW7 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm29394H3BIW7 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Gm29394H3BIW7 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm29394H3BIW7 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm29394H3BIW7 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm29394H3BIW7 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm29394H3BIW7 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm29394H3BIW7 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm29394H3BIW7 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm29394H3BIW7 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm29394H3BIW7 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm29394H3BIW7 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm29394H3BIW7 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms