Protein–RNA interactions for Protein: G3XA52

Vmn1r34, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r34G3XA52 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vmn1r34G3XA52 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vmn1r34G3XA52 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vmn1r34G3XA52 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vmn1r34G3XA52 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vmn1r34G3XA52 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vmn1r34G3XA52 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vmn1r34G3XA52 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vmn1r34G3XA52 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vmn1r34G3XA52 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vmn1r34G3XA52 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Vmn1r34G3XA52 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vmn1r34G3XA52 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Vmn1r34G3XA52 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vmn1r34G3XA52 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vmn1r34G3XA52 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vmn1r34G3XA52 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vmn1r34G3XA52 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vmn1r34G3XA52 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vmn1r34G3XA52 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vmn1r34G3XA52 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Vmn1r34G3XA52 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vmn1r34G3XA52 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vmn1r34G3XA52 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vmn1r34G3XA52 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vmn1r34G3XA52 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vmn1r34G3XA52 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vmn1r34G3XA52 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vmn1r34G3XA52 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vmn1r34G3XA52 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Vmn1r34G3XA52 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vmn1r34G3XA52 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vmn1r34G3XA52 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vmn1r34G3XA52 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vmn1r34G3XA52 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vmn1r34G3XA52 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vmn1r34G3XA52 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vmn1r34G3XA52 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vmn1r34G3XA52 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vmn1r34G3XA52 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vmn1r34G3XA52 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vmn1r34G3XA52 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Vmn1r34G3XA52 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Vmn1r34G3XA52 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vmn1r34G3XA52 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Vmn1r34G3XA52 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vmn1r34G3XA52 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Vmn1r34G3XA52 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vmn1r34G3XA52 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vmn1r34G3XA52 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vmn1r34G3XA52 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vmn1r34G3XA52 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vmn1r34G3XA52 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vmn1r34G3XA52 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vmn1r34G3XA52 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vmn1r34G3XA52 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vmn1r34G3XA52 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vmn1r34G3XA52 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Vmn1r34G3XA52 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vmn1r34G3XA52 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vmn1r34G3XA52 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vmn1r34G3XA52 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vmn1r34G3XA52 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vmn1r34G3XA52 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vmn1r34G3XA52 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vmn1r34G3XA52 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vmn1r34G3XA52 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vmn1r34G3XA52 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vmn1r34G3XA52 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vmn1r34G3XA52 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vmn1r34G3XA52 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vmn1r34G3XA52 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vmn1r34G3XA52 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vmn1r34G3XA52 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vmn1r34G3XA52 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vmn1r34G3XA52 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vmn1r34G3XA52 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vmn1r34G3XA52 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vmn1r34G3XA52 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vmn1r34G3XA52 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vmn1r34G3XA52 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Vmn1r34G3XA52 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vmn1r34G3XA52 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vmn1r34G3XA52 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Vmn1r34G3XA52 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vmn1r34G3XA52 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vmn1r34G3XA52 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vmn1r34G3XA52 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Vmn1r34G3XA52 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vmn1r34G3XA52 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vmn1r34G3XA52 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vmn1r34G3XA52 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Vmn1r34G3XA52 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vmn1r34G3XA52 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Vmn1r34G3XA52 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vmn1r34G3XA52 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vmn1r34G3XA52 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vmn1r34G3XA52 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vmn1r34G3XA52 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Vmn1r34G3XA52 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.8 ms