Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU6

Usp9y, Ubiquitin-specific peptidase 9, Y chromosome, mousemouse

Predictions only

Length 2,556 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9yF8VPU6 1700009J07Rik-202ENSMUST00000185309 920 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 Gm43547-201ENSMUST00000197729 328 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 Gm43671-201ENSMUST00000200422 433 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 AC159890.1-201ENSMUST00000215382 684 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 Hpf1-201ENSMUST00000037190 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 Pex2-201ENSMUST00000059021 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 Cdk1-202ENSMUST00000119827 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 Gm11244-201ENSMUST00000121243 237 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 Mid1-ps1-201ENSMUST00000167967 1248 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 Auts2-216ENSMUST00000185450 144 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 Tpi-rs4-201ENSMUST00000213734 720 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 Gm26818-201ENSMUST00000181367 1360 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 Schip1-202ENSMUST00000169909 1517 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 E330034L11Rik-201ENSMUST00000200640 1742 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 Gm8019-201ENSMUST00000119317 587 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 Gm9644-201ENSMUST00000212828 1183 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 AC169511.1-201ENSMUST00000227639 995 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 Ccdc30-203ENSMUST00000084307 989 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 Zc3hc1-202ENSMUST00000102992 1865 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 Gm23745-201ENSMUST00000104230 125 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 Nifk-202ENSMUST00000112688 849 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 Gm11789-203ENSMUST00000140645 737 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 Ppy-202ENSMUST00000170554 487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 Gm20493-201ENSMUST00000173706 213 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 Gm30731-201ENSMUST00000203909 825 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 AC156790.2-201ENSMUST00000227115 568 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 Krtap2-4-201ENSMUST00000074926 828 ntAPPRIS P1 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 Ppm1b-203ENSMUST00000112305 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 Nudt6-203ENSMUST00000108117 879 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 Gm7861-201ENSMUST00000110749 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 Gm7849-201ENSMUST00000110752 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 Gm15886-201ENSMUST00000123155 1250 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 Gm5267-201ENSMUST00000191574 1045 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 Gm44315-201ENSMUST00000203041 219 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.9 ms