Protein–RNA interactions for Protein: F6ZIS7

Rarres1, Retinoic acid receptor responder (tazarotene-induced) 1, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rarres1F6ZIS7 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rarres1F6ZIS7 Zscan12-203ENSMUST00000225545 4405 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rarres1F6ZIS7 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rarres1F6ZIS7 Neu2-206ENSMUST00000166259 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rarres1F6ZIS7 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rarres1F6ZIS7 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rarres1F6ZIS7 Atp4a-204ENSMUST00000170371 3447 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rarres1F6ZIS7 Phactr1-201ENSMUST00000066928 2013 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rarres1F6ZIS7 Pkp4-201ENSMUST00000037903 4378 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rarres1F6ZIS7 Fkbp15-204ENSMUST00000107461 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rarres1F6ZIS7 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rarres1F6ZIS7 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rarres1F6ZIS7 Robo1-201ENSMUST00000023600 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rarres1F6ZIS7 Gm8378-202ENSMUST00000167777 2624 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rarres1F6ZIS7 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rarres1F6ZIS7 Crot-201ENSMUST00000003720 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rarres1F6ZIS7 Ctcfl-202ENSMUST00000179693 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rarres1F6ZIS7 Pigb-206ENSMUST00000184035 3221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rarres1F6ZIS7 Ppargc1b-201ENSMUST00000063307 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rarres1F6ZIS7 1700017B05Rik-202ENSMUST00000213199 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rarres1F6ZIS7 Pcgf3-201ENSMUST00000046975 7708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rarres1F6ZIS7 Dnmt3a-218ENSMUST00000174817 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rarres1F6ZIS7 Fbxo40-201ENSMUST00000075869 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rarres1F6ZIS7 Hectd4-201ENSMUST00000042614 15482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rarres1F6ZIS7 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rarres1F6ZIS7 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rarres1F6ZIS7 Acox3-203ENSMUST00000114237 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rarres1F6ZIS7 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rarres1F6ZIS7 Vrtn-203ENSMUST00000167227 3440 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rarres1F6ZIS7 Lamb1-205ENSMUST00000169088 5557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rarres1F6ZIS7 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rarres1F6ZIS7 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rarres1F6ZIS7 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Rarres1F6ZIS7 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Rarres1F6ZIS7 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rarres1F6ZIS7 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rarres1F6ZIS7 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rarres1F6ZIS7 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rarres1F6ZIS7 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Rarres1F6ZIS7 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Rarres1F6ZIS7 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rarres1F6ZIS7 D830039M14Rik-202ENSMUST00000217740 3362 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Rarres1F6ZIS7 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Rarres1F6ZIS7 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Rarres1F6ZIS7 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Rarres1F6ZIS7 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rarres1F6ZIS7 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rarres1F6ZIS7 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rarres1F6ZIS7 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rarres1F6ZIS7 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rarres1F6ZIS7 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rarres1F6ZIS7 Edil3-202ENSMUST00000081769 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rarres1F6ZIS7 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rarres1F6ZIS7 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rarres1F6ZIS7 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rarres1F6ZIS7 Pla2g4c-201ENSMUST00000043612 3382 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rarres1F6ZIS7 D930020B18Rik-201ENSMUST00000120642 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rarres1F6ZIS7 Arhgap11a-202ENSMUST00000110947 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rarres1F6ZIS7 1110051M20Rik-201ENSMUST00000064652 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rarres1F6ZIS7 Pcdhb2-201ENSMUST00000056522 2813 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rarres1F6ZIS7 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rarres1F6ZIS7 Igf1-201ENSMUST00000062862 2292 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rarres1F6ZIS7 Slc9a8-201ENSMUST00000047815 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rarres1F6ZIS7 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rarres1F6ZIS7 Nrip3-201ENSMUST00000033331 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rarres1F6ZIS7 Baiap3-206ENSMUST00000182825 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rarres1F6ZIS7 Ica1-204ENSMUST00000115520 1876 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rarres1F6ZIS7 Car12-202ENSMUST00000085420 3639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rarres1F6ZIS7 Matn2-205ENSMUST00000227759 3569 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rarres1F6ZIS7 Gm21103-202ENSMUST00000170923 1761 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rarres1F6ZIS7 Gm20671-201ENSMUST00000144673 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rarres1F6ZIS7 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rarres1F6ZIS7 Rasal1-201ENSMUST00000031606 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rarres1F6ZIS7 Poldip3-202ENSMUST00000100375 3157 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rarres1F6ZIS7 Lama4-201ENSMUST00000019992 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rarres1F6ZIS7 Susd4-201ENSMUST00000085724 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rarres1F6ZIS7 Mpl-202ENSMUST00000102671 2934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rarres1F6ZIS7 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rarres1F6ZIS7 Fbxo43-201ENSMUST00000058643 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rarres1F6ZIS7 Zfp384-205ENSMUST00000112424 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rarres1F6ZIS7 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rarres1F6ZIS7 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rarres1F6ZIS7 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rarres1F6ZIS7 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Rarres1F6ZIS7 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rarres1F6ZIS7 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rarres1F6ZIS7 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rarres1F6ZIS7 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rarres1F6ZIS7 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rarres1F6ZIS7 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rarres1F6ZIS7 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rarres1F6ZIS7 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Rarres1F6ZIS7 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Rarres1F6ZIS7 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Rarres1F6ZIS7 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rarres1F6ZIS7 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rarres1F6ZIS7 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rarres1F6ZIS7 Elavl2-201ENSMUST00000008633 3730 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rarres1F6ZIS7 Spock2-203ENSMUST00000165024 3699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rarres1F6ZIS7 Myo1b-201ENSMUST00000018561 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms