Protein–RNA interactions for Protein: F6VKC7

Zfp988, Zinc finger protein 988, mousemouse

Predictions only

Length 633 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp988F6VKC7 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Zfp988F6VKC7 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Zfp988F6VKC7 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Zfp988F6VKC7 Kir3dl2-202ENSMUST00000113108 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Zfp988F6VKC7 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Zfp988F6VKC7 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Zfp988F6VKC7 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Zfp988F6VKC7 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Zfp988F6VKC7 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Zfp988F6VKC7 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Zfp988F6VKC7 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Zfp988F6VKC7 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Zfp988F6VKC7 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Zfp988F6VKC7 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Zfp988F6VKC7 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Zfp988F6VKC7 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Zfp988F6VKC7 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Zfp988F6VKC7 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
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Zfp988F6VKC7 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Zfp988F6VKC7 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
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Zfp988F6VKC7 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
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Zfp988F6VKC7 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
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Zfp988F6VKC7 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Zfp988F6VKC7 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
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Zfp988F6VKC7 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Zfp988F6VKC7 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Zfp988F6VKC7 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Zfp988F6VKC7 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Zfp988F6VKC7 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Zfp988F6VKC7 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Zfp988F6VKC7 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Zfp988F6VKC7 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Zfp988F6VKC7 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
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Zfp988F6VKC7 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
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Zfp988F6VKC7 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Zfp988F6VKC7 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Zfp988F6VKC7 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Zfp988F6VKC7 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
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Zfp988F6VKC7 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Zfp988F6VKC7 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Zfp988F6VKC7 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Zfp988F6VKC7 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Zfp988F6VKC7 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Zfp988F6VKC7 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
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Zfp988F6VKC7 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Zfp988F6VKC7 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
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Zfp988F6VKC7 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
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Zfp988F6VKC7 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Zfp988F6VKC7 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Zfp988F6VKC7 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Zfp988F6VKC7 Smtn-210ENSMUST00000170588 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Zfp988F6VKC7 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Zfp988F6VKC7 Ddah1-202ENSMUST00000120310 2291 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Zfp988F6VKC7 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Zfp988F6VKC7 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Zfp988F6VKC7 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Zfp988F6VKC7 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Zfp988F6VKC7 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Zfp988F6VKC7 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Zfp988F6VKC7 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Zfp988F6VKC7 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Zfp988F6VKC7 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Zfp988F6VKC7 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Zfp988F6VKC7 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Zfp988F6VKC7 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Zfp988F6VKC7 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Zfp988F6VKC7 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Zfp988F6VKC7 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Zfp988F6VKC7 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Zfp988F6VKC7 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Zfp988F6VKC7 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Zfp988F6VKC7 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Zfp988F6VKC7 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Zfp988F6VKC7 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Zfp988F6VKC7 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Zfp988F6VKC7 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
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