Protein–RNA interactions for Protein: E9QLQ1

Defa35, Defensin, alpha, 35, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa35E9QLQ1 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Defa35E9QLQ1 Alms1-201ENSMUST00000072018 9986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Defa35E9QLQ1 Scn5a-203ENSMUST00000120420 7536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
Defa35E9QLQ1 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC8.95□□□□□ -0.98
Defa35E9QLQ1 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC8.95□□□□□ -0.98
Defa35E9QLQ1 Cd276-201ENSMUST00000039788 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Defa35E9QLQ1 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Defa35E9QLQ1 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.95□□□□□ -0.98
Defa35E9QLQ1 Rgs3-202ENSMUST00000084521 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
Defa35E9QLQ1 Parvg-207ENSMUST00000163667 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
Defa35E9QLQ1 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Defa35E9QLQ1 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Defa35E9QLQ1 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Defa35E9QLQ1 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Defa35E9QLQ1 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Defa35E9QLQ1 Srsf6-203ENSMUST00000130411 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
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Defa35E9QLQ1 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.94□□□□□ -0.98
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Defa35E9QLQ1 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.94□□□□□ -0.98
Defa35E9QLQ1 Lig1-211ENSMUST00000177588 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.94□□□□□ -0.98
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Defa35E9QLQ1 Usp45-201ENSMUST00000040429 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
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Defa35E9QLQ1 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
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Defa35E9QLQ1 Ppp6r3-203ENSMUST00000172362 4633 ntTSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
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Defa35E9QLQ1 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC8.94□□□□□ -0.98
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Defa35E9QLQ1 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Defa35E9QLQ1 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC8.93□□□□□ -0.98
Defa35E9QLQ1 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Defa35E9QLQ1 Gm43597-202ENSMUST00000201992 4620 ntTSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Defa35E9QLQ1 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Defa35E9QLQ1 Syt15-201ENSMUST00000035351 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Defa35E9QLQ1 Elavl2-201ENSMUST00000008633 3730 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Defa35E9QLQ1 Igf1-201ENSMUST00000062862 2292 ntTSL 2 BASIC8.93□□□□□ -0.98
Defa35E9QLQ1 Gm5703-201ENSMUST00000186658 3973 ntBASIC8.93□□□□□ -0.98
Defa35E9QLQ1 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Defa35E9QLQ1 Ctsl-205ENSMUST00000222517 6168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.93□□□□□ -0.98
Defa35E9QLQ1 Svil-204ENSMUST00000127297 6243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.93□□□□□ -0.98
Defa35E9QLQ1 Polr2a-201ENSMUST00000058470 6740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Defa35E9QLQ1 Gm15983-201ENSMUST00000140000 4814 ntTSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Defa35E9QLQ1 Acot11-202ENSMUST00000102762 5689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Defa35E9QLQ1 Cacna1c-202ENSMUST00000078320 8062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Defa35E9QLQ1 Wdr43-201ENSMUST00000047086 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Defa35E9QLQ1 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Defa35E9QLQ1 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Defa35E9QLQ1 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Defa35E9QLQ1 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC8.93□□□□□ -0.98
Defa35E9QLQ1 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC8.93□□□□□ -0.98
Defa35E9QLQ1 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC8.93□□□□□ -0.98
Defa35E9QLQ1 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Defa35E9QLQ1 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Defa35E9QLQ1 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC8.93□□□□□ -0.98
Defa35E9QLQ1 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Defa35E9QLQ1 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC8.93□□□□□ -0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms