Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1F5

Myo5c, Myosin VC, mousemouse

Predictions only

Length 1,742 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo5cE9Q1F5 AC164429.1-201ENSMUST00000224210 518 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Myo5cE9Q1F5 Iqcf1-201ENSMUST00000085114 613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Myo5cE9Q1F5 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Myo5cE9Q1F5 Mphosph10-201ENSMUST00000032735 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Myo5cE9Q1F5 Aldoa-201ENSMUST00000032934 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Myo5cE9Q1F5 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Myo5cE9Q1F5 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Myo5cE9Q1F5 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Myo5cE9Q1F5 Gm5822-201ENSMUST00000161562 1378 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Myo5cE9Q1F5 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Myo5cE9Q1F5 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Myo5cE9Q1F5 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Myo5cE9Q1F5 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Myo5cE9Q1F5 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Myo5cE9Q1F5 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Myo5cE9Q1F5 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Myo5cE9Q1F5 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Myo5cE9Q1F5 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Myo5cE9Q1F5 Ighv8-11-201ENSMUST00000103536 358 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Myo5cE9Q1F5 Ifitm1-202ENSMUST00000106040 560 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Myo5cE9Q1F5 Ifitm1-203ENSMUST00000106042 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Myo5cE9Q1F5 Smim8-204ENSMUST00000108133 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Myo5cE9Q1F5 Hint1-202ENSMUST00000117710 580 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Myo5cE9Q1F5 Slfn5os-201ENSMUST00000127074 574 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Myo5cE9Q1F5 Tpi1-203ENSMUST00000149610 802 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Myo5cE9Q1F5 Gm17221-201ENSMUST00000163909 481 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Myo5cE9Q1F5 Gm17073-201ENSMUST00000168069 556 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Myo5cE9Q1F5 Scgb2b7-201ENSMUST00000178258 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Myo5cE9Q1F5 4930578M01Rik-201ENSMUST00000180490 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Myo5cE9Q1F5 2410002F23Rik-220ENSMUST00000191537 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Myo5cE9Q1F5 Gm31274-201ENSMUST00000197356 229 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Myo5cE9Q1F5 Gm13539-202ENSMUST00000211245 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Myo5cE9Q1F5 CT025531.1-201ENSMUST00000214534 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Myo5cE9Q1F5 Ifitm1-201ENSMUST00000026564 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Myo5cE9Q1F5 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Myo5cE9Q1F5 Mir326-201ENSMUST00000083637 95 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Myo5cE9Q1F5 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Myo5cE9Q1F5 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Myo5cE9Q1F5 Gm45012-201ENSMUST00000208323 1666 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Myo5cE9Q1F5 Fcrla-201ENSMUST00000046322 1679 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Myo5cE9Q1F5 Fbp2-201ENSMUST00000021907 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Myo5cE9Q1F5 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Myo5cE9Q1F5 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Myo5cE9Q1F5 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Myo5cE9Q1F5 Gm37651-201ENSMUST00000194679 1494 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
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Myo5cE9Q1F5 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Myo5cE9Q1F5 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Myo5cE9Q1F5 Gm3409-202ENSMUST00000110599 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Myo5cE9Q1F5 Surf6-202ENSMUST00000114043 894 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Myo5cE9Q1F5 Gm12129-201ENSMUST00000120104 1147 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
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Myo5cE9Q1F5 Gm3415-202ENSMUST00000179214 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
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Myo5cE9Q1F5 Gm3409-203ENSMUST00000199142 1167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
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Myo5cE9Q1F5 Gm43854-201ENSMUST00000200418 394 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Myo5cE9Q1F5 4933402C05Rik-201ENSMUST00000208189 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Myo5cE9Q1F5 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Myo5cE9Q1F5 Slc35a4-201ENSMUST00000036158 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Myo5cE9Q1F5 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Myo5cE9Q1F5 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Myo5cE9Q1F5 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Myo5cE9Q1F5 Dcaf12-201ENSMUST00000030145 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Myo5cE9Q1F5 Nr1i3-201ENSMUST00000005820 1414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Myo5cE9Q1F5 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Myo5cE9Q1F5 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Myo5cE9Q1F5 Gm44573-201ENSMUST00000191753 2370 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Myo5cE9Q1F5 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Myo5cE9Q1F5 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Myo5cE9Q1F5 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Myo5cE9Q1F5 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Myo5cE9Q1F5 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Myo5cE9Q1F5 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Myo5cE9Q1F5 Polr3c-205ENSMUST00000141377 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Myo5cE9Q1F5 Fxyd5-203ENSMUST00000159924 805 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Myo5cE9Q1F5 Fxyd5-210ENSMUST00000162116 817 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Myo5cE9Q1F5 Gm9353-201ENSMUST00000200472 604 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Myo5cE9Q1F5 Gm45572-201ENSMUST00000211774 750 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Myo5cE9Q1F5 Bloc1s1-201ENSMUST00000026405 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Myo5cE9Q1F5 Gm13271-201ENSMUST00000094992 549 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.4 ms