Protein–RNA interactions for Protein: E0CXM8

Gm43720, Predicted gene 43720, mousemouse

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Length 267 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm43720E0CXM8 Tuft1-204ENSMUST00000196733 2555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm43720E0CXM8 Zfp780b-201ENSMUST00000081618 3004 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Gm43720E0CXM8 Dzip1l-203ENSMUST00000112885 4350 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm43720E0CXM8 Morc3-206ENSMUST00000202261 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm43720E0CXM8 Morc3-201ENSMUST00000044068 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Gm43720E0CXM8 Frg2f1-201ENSMUST00000079611 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm43720E0CXM8 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm43720E0CXM8 Rbm14-202ENSMUST00000113793 3508 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm43720E0CXM8 Pcdhb9-201ENSMUST00000057228 3055 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Gm43720E0CXM8 Fam234b-201ENSMUST00000111915 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm43720E0CXM8 Sgk3-203ENSMUST00000168907 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm43720E0CXM8 Anks1b-216ENSMUST00000182430 3305 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Gm43720E0CXM8 Txnrd1-201ENSMUST00000020484 3325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm43720E0CXM8 Swap70-201ENSMUST00000033325 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm43720E0CXM8 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Gm43720E0CXM8 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC10□□□□□ -0.81
Gm43720E0CXM8 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Gm43720E0CXM8 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm43720E0CXM8 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Gm43720E0CXM8 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm43720E0CXM8 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Gm43720E0CXM8 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm43720E0CXM8 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Gm43720E0CXM8 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Gm43720E0CXM8 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm43720E0CXM8 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Gm43720E0CXM8 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Gm43720E0CXM8 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
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Gm43720E0CXM8 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
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Gm43720E0CXM8 Loxl3-201ENSMUST00000000707 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm43720E0CXM8 Plpp3-201ENSMUST00000064139 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm43720E0CXM8 Lrba-202ENSMUST00000192145 8843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm43720E0CXM8 Dnmt3a-218ENSMUST00000174817 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm43720E0CXM8 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm43720E0CXM8 Nmt2-201ENSMUST00000081932 4461 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm43720E0CXM8 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm43720E0CXM8 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm43720E0CXM8 Pgf-201ENSMUST00000004913 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm43720E0CXM8 Ebf2-203ENSMUST00000176161 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm43720E0CXM8 Fga-202ENSMUST00000166581 2587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Gm43720E0CXM8 Clip1-202ENSMUST00000063905 4589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Gm43720E0CXM8 Pde6c-202ENSMUST00000112329 2895 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
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Gm43720E0CXM8 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Gm43720E0CXM8 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm43720E0CXM8 Thbs2-201ENSMUST00000170872 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm43720E0CXM8 Acsf2-201ENSMUST00000103164 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm43720E0CXM8 Pigq-219ENSMUST00000208071 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Gm43720E0CXM8 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
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Gm43720E0CXM8 Dhx40-201ENSMUST00000018569 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm43720E0CXM8 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm43720E0CXM8 Enam-201ENSMUST00000031222 5483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm43720E0CXM8 Asb1-201ENSMUST00000027538 5826 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm43720E0CXM8 Exoc4-202ENSMUST00000090381 2598 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
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Gm43720E0CXM8 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
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Gm43720E0CXM8 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm43720E0CXM8 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
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Gm43720E0CXM8 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm43720E0CXM8 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm43720E0CXM8 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
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Gm43720E0CXM8 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm43720E0CXM8 Zfp629-201ENSMUST00000058038 6120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm43720E0CXM8 Ciita-201ENSMUST00000023147 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm43720E0CXM8 B630019A10Rik-201ENSMUST00000149488 2407 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm43720E0CXM8 Cacna1c-205ENSMUST00000112825 7577 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm43720E0CXM8 Kng2-203ENSMUST00000115349 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm43720E0CXM8 Tfap2b-204ENSMUST00000187754 3023 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm43720E0CXM8 Nfya-201ENSMUST00000046719 3645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm43720E0CXM8 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm43720E0CXM8 Kcnma1-205ENSMUST00000145596 12094 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm43720E0CXM8 Ptgfr-201ENSMUST00000029670 6624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm43720E0CXM8 Gm26527-201ENSMUST00000180416 1948 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm43720E0CXM8 Kcns2-202ENSMUST00000228725 4906 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm43720E0CXM8 Slc29a3-201ENSMUST00000117513 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
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