Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6J4

Vpreb3, Pre-B lymphocyte gene 3, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb3D3Z6J4 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Vpreb3D3Z6J4 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Vpreb3D3Z6J4 Zfp532-201ENSMUST00000049016 5503 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Vpreb3D3Z6J4 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Vpreb3D3Z6J4 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Vpreb3D3Z6J4 Lima1-201ENSMUST00000073691 4215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Vpreb3D3Z6J4 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Vpreb3D3Z6J4 Ccdc187-202ENSMUST00000217256 9411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Vpreb3D3Z6J4 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Vpreb3D3Z6J4 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Vpreb3D3Z6J4 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Vpreb3D3Z6J4 Ctsl-205ENSMUST00000222517 6168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Vpreb3D3Z6J4 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Vpreb3D3Z6J4 Bloc1s5-201ENSMUST00000035899 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Vpreb3D3Z6J4 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Vpreb3D3Z6J4 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Vpreb3D3Z6J4 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Vpreb3D3Z6J4 Dhx34-201ENSMUST00000094816 4073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Vpreb3D3Z6J4 Zzef1-208ENSMUST00000207107 11306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Vpreb3D3Z6J4 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Vpreb3D3Z6J4 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Vpreb3D3Z6J4 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Vpreb3D3Z6J4 Gcc2-201ENSMUST00000057659 6547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Vpreb3D3Z6J4 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Vpreb3D3Z6J4 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Vpreb3D3Z6J4 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Vpreb3D3Z6J4 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Vpreb3D3Z6J4 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Vpreb3D3Z6J4 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Vpreb3D3Z6J4 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Vpreb3D3Z6J4 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Vpreb3D3Z6J4 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Vpreb3D3Z6J4 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Vpreb3D3Z6J4 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Vpreb3D3Z6J4 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Vpreb3D3Z6J4 Ano1-202ENSMUST00000118556 4566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Vpreb3D3Z6J4 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Vpreb3D3Z6J4 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Vpreb3D3Z6J4 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Vpreb3D3Z6J4 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Vpreb3D3Z6J4 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Vpreb3D3Z6J4 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Vpreb3D3Z6J4 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Vpreb3D3Z6J4 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Vpreb3D3Z6J4 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Vpreb3D3Z6J4 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Vpreb3D3Z6J4 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Vpreb3D3Z6J4 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Vpreb3D3Z6J4 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Vpreb3D3Z6J4 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Vpreb3D3Z6J4 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Vpreb3D3Z6J4 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Vpreb3D3Z6J4 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Vpreb3D3Z6J4 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Vpreb3D3Z6J4 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Vpreb3D3Z6J4 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Vpreb3D3Z6J4 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Vpreb3D3Z6J4 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Vpreb3D3Z6J4 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Vpreb3D3Z6J4 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Vpreb3D3Z6J4 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Vpreb3D3Z6J4 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Vpreb3D3Z6J4 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Vpreb3D3Z6J4 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Vpreb3D3Z6J4 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Vpreb3D3Z6J4 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Vpreb3D3Z6J4 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Vpreb3D3Z6J4 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Vpreb3D3Z6J4 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Vpreb3D3Z6J4 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Vpreb3D3Z6J4 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Vpreb3D3Z6J4 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Vpreb3D3Z6J4 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Vpreb3D3Z6J4 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Vpreb3D3Z6J4 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Vpreb3D3Z6J4 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Vpreb3D3Z6J4 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Vpreb3D3Z6J4 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Vpreb3D3Z6J4 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Vpreb3D3Z6J4 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Vpreb3D3Z6J4 Olfr569-202ENSMUST00000217024 4741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Vpreb3D3Z6J4 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Vpreb3D3Z6J4 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Vpreb3D3Z6J4 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Vpreb3D3Z6J4 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Vpreb3D3Z6J4 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Vpreb3D3Z6J4 Sipa1l2-202ENSMUST00000212168 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Vpreb3D3Z6J4 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Vpreb3D3Z6J4 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Vpreb3D3Z6J4 Shroom2-201ENSMUST00000062317 6997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Vpreb3D3Z6J4 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Vpreb3D3Z6J4 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Vpreb3D3Z6J4 Brsk2-216ENSMUST00000174499 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Vpreb3D3Z6J4 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Vpreb3D3Z6J4 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Vpreb3D3Z6J4 Kif14-201ENSMUST00000047817 8770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Vpreb3D3Z6J4 Sema4c-202ENSMUST00000191642 3892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Vpreb3D3Z6J4 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Vpreb3D3Z6J4 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Vpreb3D3Z6J4 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms