Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cep250-202ENSMUST00000094421 7919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Itga11-201ENSMUST00000034774 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Myo1b-201ENSMUST00000018561 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc9a3-203ENSMUST00000221703 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fam84a-201ENSMUST00000020926 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dclk1-204ENSMUST00000196745 7962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Steap3-203ENSMUST00000112641 5158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Plekha6-204ENSMUST00000187285 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Unc79-202ENSMUST00000101099 8874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ank1-204ENSMUST00000117270 5652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cln8-201ENSMUST00000027554 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Myo1h-210ENSMUST00000202006 4631 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm29895-201ENSMUST00000209933 5652 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Trim9-202ENSMUST00000110522 4405 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Scml2-201ENSMUST00000019101 4842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Myocd-203ENSMUST00000108695 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tsc2-201ENSMUST00000097373 6018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp68-203ENSMUST00000110905 4749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Arhgef4-204ENSMUST00000159747 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Abt1-201ENSMUST00000041782 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms