Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PtprbB2RU80 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
PtprbB2RU80 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
PtprbB2RU80 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PtprbB2RU80 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PtprbB2RU80 Gm17213-201ENSMUST00000165161 1360 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
PtprbB2RU80 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
PtprbB2RU80 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PtprbB2RU80 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
PtprbB2RU80 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PtprbB2RU80 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
PtprbB2RU80 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PtprbB2RU80 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
PtprbB2RU80 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PtprbB2RU80 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PtprbB2RU80 Rbm3-205ENSMUST00000115619 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
PtprbB2RU80 Gm14942-201ENSMUST00000119642 336 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
PtprbB2RU80 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
PtprbB2RU80 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
PtprbB2RU80 Gm15619-201ENSMUST00000128415 1294 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
PtprbB2RU80 Gm21972-201ENSMUST00000135197 776 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
PtprbB2RU80 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
PtprbB2RU80 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
PtprbB2RU80 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
PtprbB2RU80 Gm16271-201ENSMUST00000162837 220 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
PtprbB2RU80 Gm37981-201ENSMUST00000194280 535 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
PtprbB2RU80 Nmi-201ENSMUST00000028314 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PtprbB2RU80 Them5-201ENSMUST00000029794 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PtprbB2RU80 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
PtprbB2RU80 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PtprbB2RU80 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PtprbB2RU80 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
PtprbB2RU80 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
PtprbB2RU80 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PtprbB2RU80 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PtprbB2RU80 5530401A14Rik-201ENSMUST00000021044 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PtprbB2RU80 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PtprbB2RU80 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PtprbB2RU80 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PtprbB2RU80 Gm4900-201ENSMUST00000222046 1628 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
PtprbB2RU80 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PtprbB2RU80 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PtprbB2RU80 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
PtprbB2RU80 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PtprbB2RU80 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
PtprbB2RU80 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
PtprbB2RU80 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PtprbB2RU80 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PtprbB2RU80 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PtprbB2RU80 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PtprbB2RU80 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
PtprbB2RU80 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PtprbB2RU80 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PtprbB2RU80 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PtprbB2RU80 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PtprbB2RU80 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PtprbB2RU80 Ighv7-2-201ENSMUST00000103462 354 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
PtprbB2RU80 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
PtprbB2RU80 Rbmx2-ps-201ENSMUST00000119377 930 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
PtprbB2RU80 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
PtprbB2RU80 Spata3-207ENSMUST00000135440 732 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PtprbB2RU80 4631405J19Rik-204ENSMUST00000145926 936 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
PtprbB2RU80 Gzmc-201ENSMUST00000015585 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PtprbB2RU80 Tmem40-206ENSMUST00000170625 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
PtprbB2RU80 Gm10807-201ENSMUST00000177134 795 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
PtprbB2RU80 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
PtprbB2RU80 Gm7137-201ENSMUST00000180161 711 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
PtprbB2RU80 Gm27232-201ENSMUST00000184373 597 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
PtprbB2RU80 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
PtprbB2RU80 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
PtprbB2RU80 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
PtprbB2RU80 AC164618.2-201ENSMUST00000224770 573 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
PtprbB2RU80 Mgp-201ENSMUST00000032342 617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PtprbB2RU80 Spata3-201ENSMUST00000052854 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PtprbB2RU80 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PtprbB2RU80 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PtprbB2RU80 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PtprbB2RU80 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PtprbB2RU80 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PtprbB2RU80 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PtprbB2RU80 Ecsit-204ENSMUST00000180180 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PtprbB2RU80 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PtprbB2RU80 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
PtprbB2RU80 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PtprbB2RU80 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
PtprbB2RU80 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
PtprbB2RU80 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
PtprbB2RU80 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
PtprbB2RU80 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
PtprbB2RU80 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
PtprbB2RU80 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
PtprbB2RU80 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
PtprbB2RU80 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
PtprbB2RU80 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
PtprbB2RU80 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
PtprbB2RU80 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
PtprbB2RU80 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
PtprbB2RU80 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
PtprbB2RU80 Rpl9-ps7-201ENSMUST00000140507 579 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
PtprbB2RU80 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms