Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

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Length 936 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Spocd1B1ASB6 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Spocd1B1ASB6 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Spocd1B1ASB6 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Spocd1B1ASB6 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Spocd1B1ASB6 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Spocd1B1ASB6 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Spocd1B1ASB6 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Spocd1B1ASB6 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Spocd1B1ASB6 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Spocd1B1ASB6 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Spocd1B1ASB6 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Spocd1B1ASB6 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Spocd1B1ASB6 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Spocd1B1ASB6 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Spocd1B1ASB6 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Spocd1B1ASB6 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Spocd1B1ASB6 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Spocd1B1ASB6 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Spocd1B1ASB6 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Spocd1B1ASB6 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Spocd1B1ASB6 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Spocd1B1ASB6 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Spocd1B1ASB6 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Spocd1B1ASB6 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Spocd1B1ASB6 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Spocd1B1ASB6 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Spocd1B1ASB6 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Spocd1B1ASB6 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Spocd1B1ASB6 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Spocd1B1ASB6 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Spocd1B1ASB6 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Spocd1B1ASB6 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Spocd1B1ASB6 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Spocd1B1ASB6 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Spocd1B1ASB6 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Spocd1B1ASB6 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Spocd1B1ASB6 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Spocd1B1ASB6 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Spocd1B1ASB6 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Spocd1B1ASB6 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Spocd1B1ASB6 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Spocd1B1ASB6 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Spocd1B1ASB6 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Spocd1B1ASB6 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Spocd1B1ASB6 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Spocd1B1ASB6 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Spocd1B1ASB6 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Spocd1B1ASB6 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Spocd1B1ASB6 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Spocd1B1ASB6 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Spocd1B1ASB6 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Spocd1B1ASB6 Gm11434-201ENSMUST00000122379 629 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Spocd1B1ASB6 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Spocd1B1ASB6 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Spocd1B1ASB6 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Spocd1B1ASB6 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Spocd1B1ASB6 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Spocd1B1ASB6 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Spocd1B1ASB6 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Spocd1B1ASB6 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Spocd1B1ASB6 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Spocd1B1ASB6 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Spocd1B1ASB6 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Spocd1B1ASB6 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Spocd1B1ASB6 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Spocd1B1ASB6 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Spocd1B1ASB6 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Spocd1B1ASB6 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Spocd1B1ASB6 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Spocd1B1ASB6 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Spocd1B1ASB6 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Spocd1B1ASB6 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Spocd1B1ASB6 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Spocd1B1ASB6 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Spocd1B1ASB6 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Spocd1B1ASB6 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Spocd1B1ASB6 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Spocd1B1ASB6 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Spocd1B1ASB6 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Spocd1B1ASB6 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Spocd1B1ASB6 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Spocd1B1ASB6 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Spocd1B1ASB6 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Spocd1B1ASB6 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Spocd1B1ASB6 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Spocd1B1ASB6 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Spocd1B1ASB6 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Spocd1B1ASB6 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Spocd1B1ASB6 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Spocd1B1ASB6 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Spocd1B1ASB6 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Spocd1B1ASB6 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Spocd1B1ASB6 AC073947.1-201ENSMUST00000216991 649 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Spocd1B1ASB6 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Spocd1B1ASB6 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Spocd1B1ASB6 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Spocd1B1ASB6 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Spocd1B1ASB6 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Spocd1B1ASB6 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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