Protein–RNA interactions for Protein: A2AJB1

Ccdc183, Coiled-coil domain-containing protein 183, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc183A2AJB1 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc183A2AJB1 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc183A2AJB1 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc183A2AJB1 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc183A2AJB1 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc183A2AJB1 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc183A2AJB1 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc183A2AJB1 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc183A2AJB1 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc183A2AJB1 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc183A2AJB1 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc183A2AJB1 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc183A2AJB1 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc183A2AJB1 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc183A2AJB1 Pip5k1a-204ENSMUST00000107232 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc183A2AJB1 AU019823-201ENSMUST00000131351 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc183A2AJB1 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc183A2AJB1 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc183A2AJB1 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc183A2AJB1 Fkbp15-204ENSMUST00000107461 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc183A2AJB1 Sell-201ENSMUST00000027871 2199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc183A2AJB1 Sparc-202ENSMUST00000108858 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc183A2AJB1 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc183A2AJB1 Zswim9-203ENSMUST00000119558 3111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc183A2AJB1 Gm20649-201ENSMUST00000160950 2740 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc183A2AJB1 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc183A2AJB1 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc183A2AJB1 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc183A2AJB1 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc183A2AJB1 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc183A2AJB1 Irak4-202ENSMUST00000109248 3437 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc183A2AJB1 Slc19a1-201ENSMUST00000105410 2347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc183A2AJB1 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc183A2AJB1 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc183A2AJB1 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc183A2AJB1 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc183A2AJB1 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc183A2AJB1 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc183A2AJB1 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc183A2AJB1 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc183A2AJB1 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc183A2AJB1 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc183A2AJB1 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc183A2AJB1 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc183A2AJB1 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc183A2AJB1 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc183A2AJB1 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc183A2AJB1 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc183A2AJB1 Phactr1-201ENSMUST00000066928 2013 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc183A2AJB1 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc183A2AJB1 Ap2b1-206ENSMUST00000176523 2742 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc183A2AJB1 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc183A2AJB1 Btnl1-201ENSMUST00000080254 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc183A2AJB1 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc183A2AJB1 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc183A2AJB1 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc183A2AJB1 Add2-207ENSMUST00000203724 3143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc183A2AJB1 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc183A2AJB1 Gm45272-203ENSMUST00000211111 1693 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc183A2AJB1 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc183A2AJB1 Btg2-201ENSMUST00000020692 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc183A2AJB1 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc183A2AJB1 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc183A2AJB1 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc183A2AJB1 Gm38292-201ENSMUST00000192646 3045 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc183A2AJB1 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc183A2AJB1 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc183A2AJB1 Gm12316-201ENSMUST00000125853 406 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc183A2AJB1 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc183A2AJB1 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc183A2AJB1 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc183A2AJB1 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc183A2AJB1 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc183A2AJB1 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc183A2AJB1 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc183A2AJB1 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc183A2AJB1 Ubtf-202ENSMUST00000079589 3286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc183A2AJB1 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc183A2AJB1 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc183A2AJB1 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc183A2AJB1 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc183A2AJB1 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc183A2AJB1 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc183A2AJB1 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc183A2AJB1 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc183A2AJB1 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc183A2AJB1 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc183A2AJB1 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc183A2AJB1 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc183A2AJB1 Armc3-202ENSMUST00000114640 2818 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc183A2AJB1 Pdha1-201ENSMUST00000033662 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc183A2AJB1 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc183A2AJB1 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc183A2AJB1 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc183A2AJB1 Ing1-206ENSMUST00000210740 1866 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc183A2AJB1 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc183A2AJB1 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc183A2AJB1 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc183A2AJB1 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc183A2AJB1 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.7 ms