Protein–RNA interactions for Protein: A2A8L5

Ptprf, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, mousemouse

Predictions only

Length 1,898 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprfA2A8L5 Snora73b-201ENSMUST00000083419 205 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
PtprfA2A8L5 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PtprfA2A8L5 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PtprfA2A8L5 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PtprfA2A8L5 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
PtprfA2A8L5 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
PtprfA2A8L5 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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PtprfA2A8L5 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PtprfA2A8L5 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
PtprfA2A8L5 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PtprfA2A8L5 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PtprfA2A8L5 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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PtprfA2A8L5 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PtprfA2A8L5 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PtprfA2A8L5 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
PtprfA2A8L5 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PtprfA2A8L5 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PtprfA2A8L5 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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PtprfA2A8L5 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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PtprfA2A8L5 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PtprfA2A8L5 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PtprfA2A8L5 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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PtprfA2A8L5 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PtprfA2A8L5 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PtprfA2A8L5 Slc10a3-204ENSMUST00000114147 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
PtprfA2A8L5 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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PtprfA2A8L5 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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PtprfA2A8L5 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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PtprfA2A8L5 Rdh9-203ENSMUST00000136223 1276 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PtprfA2A8L5 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PtprfA2A8L5 Ppy-201ENSMUST00000017460 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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PtprfA2A8L5 Rhox3e-201ENSMUST00000081327 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
PtprfA2A8L5 Hopx-201ENSMUST00000081964 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PtprfA2A8L5 Rhox3a2-201ENSMUST00000096459 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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PtprfA2A8L5 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PtprfA2A8L5 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PtprfA2A8L5 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PtprfA2A8L5 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PtprfA2A8L5 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
PtprfA2A8L5 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PtprfA2A8L5 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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PtprfA2A8L5 Gm11706-201ENSMUST00000151282 316 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
PtprfA2A8L5 D3Ertd751e-215ENSMUST00000195882 680 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
PtprfA2A8L5 Gm43186-201ENSMUST00000198130 824 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
PtprfA2A8L5 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PtprfA2A8L5 Tia1-211ENSMUST00000130967 1445 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PtprfA2A8L5 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
PtprfA2A8L5 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PtprfA2A8L5 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PtprfA2A8L5 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PtprfA2A8L5 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PtprfA2A8L5 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
PtprfA2A8L5 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PtprfA2A8L5 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PtprfA2A8L5 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
PtprfA2A8L5 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PtprfA2A8L5 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PtprfA2A8L5 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PtprfA2A8L5 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PtprfA2A8L5 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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