Protein–RNA interactions for Protein: Q9R059

Fhl3, Four and a half LIM domains protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fhl3Q9R059 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Fhl3Q9R059 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Fhl3Q9R059 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Fhl3Q9R059 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Fhl3Q9R059 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
Fhl3Q9R059 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Fhl3Q9R059 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Fhl3Q9R059 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Fhl3Q9R059 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Fhl3Q9R059 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Fhl3Q9R059 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Fhl3Q9R059 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Fhl3Q9R059 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Fhl3Q9R059 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Fhl3Q9R059 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.84
Fhl3Q9R059 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC9.77□□□□□ -0.84
Fhl3Q9R059 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.84
Fhl3Q9R059 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Fhl3Q9R059 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Fhl3Q9R059 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Fhl3Q9R059 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Fhl3Q9R059 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Fhl3Q9R059 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Fhl3Q9R059 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Fhl3Q9R059 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Fhl3Q9R059 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Fhl3Q9R059 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Fhl3Q9R059 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Fhl3Q9R059 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Fhl3Q9R059 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Fhl3Q9R059 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Fhl3Q9R059 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Fhl3Q9R059 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Fhl3Q9R059 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Fhl3Q9R059 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Fhl3Q9R059 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Fhl3Q9R059 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Fhl3Q9R059 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Fhl3Q9R059 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Fhl3Q9R059 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Fhl3Q9R059 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Fhl3Q9R059 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Fhl3Q9R059 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Fhl3Q9R059 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Fhl3Q9R059 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Fhl3Q9R059 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Fhl3Q9R059 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Fhl3Q9R059 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Fhl3Q9R059 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Fhl3Q9R059 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Fhl3Q9R059 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Fhl3Q9R059 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Fhl3Q9R059 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Fhl3Q9R059 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Fhl3Q9R059 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Fhl3Q9R059 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Fhl3Q9R059 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Fhl3Q9R059 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Fhl3Q9R059 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Fhl3Q9R059 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Fhl3Q9R059 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Fhl3Q9R059 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Fhl3Q9R059 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Fhl3Q9R059 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Fhl3Q9R059 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Fhl3Q9R059 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Fhl3Q9R059 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Fhl3Q9R059 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Fhl3Q9R059 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Fhl3Q9R059 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Fhl3Q9R059 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Fhl3Q9R059 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Fhl3Q9R059 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Fhl3Q9R059 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Fhl3Q9R059 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Fhl3Q9R059 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Fhl3Q9R059 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Fhl3Q9R059 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Fhl3Q9R059 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Fhl3Q9R059 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Fhl3Q9R059 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Fhl3Q9R059 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Fhl3Q9R059 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Fhl3Q9R059 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Fhl3Q9R059 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Fhl3Q9R059 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Fhl3Q9R059 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Fhl3Q9R059 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Fhl3Q9R059 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Fhl3Q9R059 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Fhl3Q9R059 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Fhl3Q9R059 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Fhl3Q9R059 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Fhl3Q9R059 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Fhl3Q9R059 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Fhl3Q9R059 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Fhl3Q9R059 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Fhl3Q9R059 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Fhl3Q9R059 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Fhl3Q9R059 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.4 ms