Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS0

Col4a3, Collagen alpha-3(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,669 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a3Q9QZS0 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Col4a3Q9QZS0 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Col4a3Q9QZS0 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Col4a3Q9QZS0 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Col4a3Q9QZS0 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Col4a3Q9QZS0 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Col4a3Q9QZS0 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Col4a3Q9QZS0 Rbms3-201ENSMUST00000044901 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Col4a3Q9QZS0 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Col4a3Q9QZS0 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Col4a3Q9QZS0 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Col4a3Q9QZS0 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Col4a3Q9QZS0 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Col4a3Q9QZS0 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Col4a3Q9QZS0 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Col4a3Q9QZS0 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Col4a3Q9QZS0 Gm44573-201ENSMUST00000191753 2370 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Col4a3Q9QZS0 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Col4a3Q9QZS0 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Col4a3Q9QZS0 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Col4a3Q9QZS0 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Col4a3Q9QZS0 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Col4a3Q9QZS0 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Col4a3Q9QZS0 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Col4a3Q9QZS0 Gm26013-201ENSMUST00000104404 119 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Col4a3Q9QZS0 Nudt6-203ENSMUST00000108117 879 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Col4a3Q9QZS0 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Col4a3Q9QZS0 Gm12030-201ENSMUST00000121917 223 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Col4a3Q9QZS0 Gm16397-201ENSMUST00000122201 494 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Col4a3Q9QZS0 4930477O15Rik-201ENSMUST00000196484 1089 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Col4a3Q9QZS0 Gm18561-201ENSMUST00000206027 804 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Col4a3Q9QZS0 Gm45460-201ENSMUST00000211385 1038 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Col4a3Q9QZS0 Gm30671-201ENSMUST00000214898 318 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Col4a3Q9QZS0 Tex30-201ENSMUST00000027215 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Col4a3Q9QZS0 Apoc4-201ENSMUST00000003071 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Col4a3Q9QZS0 Cmtm2a-201ENSMUST00000034344 1081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Col4a3Q9QZS0 Vmn1r222-201ENSMUST00000077116 1054 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Col4a3Q9QZS0 Lce1e-201ENSMUST00000090867 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Col4a3Q9QZS0 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Col4a3Q9QZS0 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Col4a3Q9QZS0 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Col4a3Q9QZS0 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Col4a3Q9QZS0 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Col4a3Q9QZS0 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Col4a3Q9QZS0 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Col4a3Q9QZS0 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Col4a3Q9QZS0 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Col4a3Q9QZS0 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Col4a3Q9QZS0 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Col4a3Q9QZS0 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Col4a3Q9QZS0 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Col4a3Q9QZS0 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Col4a3Q9QZS0 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Col4a3Q9QZS0 Gm12247-201ENSMUST00000117585 670 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Col4a3Q9QZS0 Gm12990-201ENSMUST00000120372 468 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Col4a3Q9QZS0 Gm4879-201ENSMUST00000122190 1272 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Col4a3Q9QZS0 Gm29410-201ENSMUST00000188383 694 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Col4a3Q9QZS0 Gm43852-201ENSMUST00000202098 917 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Col4a3Q9QZS0 1700026F02Rik-203ENSMUST00000211950 1082 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Col4a3Q9QZS0 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Col4a3Q9QZS0 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Col4a3Q9QZS0 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Col4a3Q9QZS0 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Col4a3Q9QZS0 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Col4a3Q9QZS0 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Col4a3Q9QZS0 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Col4a3Q9QZS0 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Col4a3Q9QZS0 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Col4a3Q9QZS0 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Col4a3Q9QZS0 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Col4a3Q9QZS0 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Col4a3Q9QZS0 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Col4a3Q9QZS0 Gm25766-201ENSMUST00000104101 131 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Col4a3Q9QZS0 Gm12795-201ENSMUST00000117594 539 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Col4a3Q9QZS0 Gm13668-201ENSMUST00000119237 1001 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Col4a3Q9QZS0 Gm13182-201ENSMUST00000122241 312 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Col4a3Q9QZS0 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Col4a3Q9QZS0 Gm20400-201ENSMUST00000173695 665 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Col4a3Q9QZS0 Gm25072-201ENSMUST00000175233 235 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Col4a3Q9QZS0 Gm8197-202ENSMUST00000193422 934 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Col4a3Q9QZS0 Gm39288-201ENSMUST00000210554 446 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Col4a3Q9QZS0 Mnd1-201ENSMUST00000047368 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Col4a3Q9QZS0 Ccl21a-201ENSMUST00000095114 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Col4a3Q9QZS0 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Col4a3Q9QZS0 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Col4a3Q9QZS0 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Col4a3Q9QZS0 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Col4a3Q9QZS0 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Col4a3Q9QZS0 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Col4a3Q9QZS0 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Col4a3Q9QZS0 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Col4a3Q9QZS0 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Col4a3Q9QZS0 AC130823.1-201ENSMUST00000228929 1549 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Col4a3Q9QZS0 Gm10750-201ENSMUST00000099266 1506 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Col4a3Q9QZS0 Foxh1-201ENSMUST00000037824 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Col4a3Q9QZS0 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Col4a3Q9QZS0 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Col4a3Q9QZS0 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Col4a3Q9QZS0 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC12.71□□□□□ -0.38
Col4a3Q9QZS0 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
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