Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL56

Gde1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, mousemouse

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gde1Q9JL56 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gde1Q9JL56 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gde1Q9JL56 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gde1Q9JL56 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gde1Q9JL56 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gde1Q9JL56 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gde1Q9JL56 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gde1Q9JL56 Slc10a1-203ENSMUST00000218342 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gde1Q9JL56 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gde1Q9JL56 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Gde1Q9JL56 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gde1Q9JL56 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gde1Q9JL56 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gde1Q9JL56 Abi2-205ENSMUST00000187709 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gde1Q9JL56 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gde1Q9JL56 AC122018.1-201ENSMUST00000217769 1686 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gde1Q9JL56 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gde1Q9JL56 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gde1Q9JL56 Cpsf4l-202ENSMUST00000100248 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gde1Q9JL56 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gde1Q9JL56 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gde1Q9JL56 Gm25766-201ENSMUST00000104101 131 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Gde1Q9JL56 Hist1h3d-201ENSMUST00000105105 1249 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gde1Q9JL56 Gm11244-201ENSMUST00000121243 237 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Gde1Q9JL56 Gm21972-201ENSMUST00000135197 776 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gde1Q9JL56 Cdpf1-205ENSMUST00000150995 566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gde1Q9JL56 Gm10320-201ENSMUST00000170205 527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gde1Q9JL56 Gm20420-201ENSMUST00000173178 639 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gde1Q9JL56 Gm2449-201ENSMUST00000180676 585 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gde1Q9JL56 Gm5100-201ENSMUST00000195631 589 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Gde1Q9JL56 Gm5298-201ENSMUST00000201122 892 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Gde1Q9JL56 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Gde1Q9JL56 Gm35625-201ENSMUST00000210416 316 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gde1Q9JL56 Gm45338-204ENSMUST00000210658 1105 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gde1Q9JL56 CT009546.1-201ENSMUST00000222573 1120 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Gde1Q9JL56 AC118639.2-201ENSMUST00000226289 223 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Gde1Q9JL56 AC165154.1-201ENSMUST00000226661 340 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Gde1Q9JL56 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gde1Q9JL56 Omt2b-201ENSMUST00000043734 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gde1Q9JL56 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gde1Q9JL56 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gde1Q9JL56 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gde1Q9JL56 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gde1Q9JL56 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gde1Q9JL56 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gde1Q9JL56 Zmynd11-206ENSMUST00000110637 3770 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gde1Q9JL56 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gde1Q9JL56 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gde1Q9JL56 Brd4-202ENSMUST00000114475 2731 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gde1Q9JL56 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gde1Q9JL56 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gde1Q9JL56 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gde1Q9JL56 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Gde1Q9JL56 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gde1Q9JL56 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gde1Q9JL56 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gde1Q9JL56 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gde1Q9JL56 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gde1Q9JL56 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gde1Q9JL56 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gde1Q9JL56 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gde1Q9JL56 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gde1Q9JL56 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gde1Q9JL56 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gde1Q9JL56 Gm12248-202ENSMUST00000218429 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gde1Q9JL56 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gde1Q9JL56 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gde1Q9JL56 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gde1Q9JL56 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gde1Q9JL56 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Gde1Q9JL56 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gde1Q9JL56 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gde1Q9JL56 Polr2i-203ENSMUST00000108193 488 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gde1Q9JL56 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Gde1Q9JL56 Gm12628-201ENSMUST00000122193 382 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Gde1Q9JL56 Gad1-207ENSMUST00000148210 1021 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gde1Q9JL56 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gde1Q9JL56 AC160028.1-201ENSMUST00000219645 1095 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gde1Q9JL56 Gm36423-202ENSMUST00000222215 1298 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gde1Q9JL56 AC102368.1-201ENSMUST00000227161 892 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Gde1Q9JL56 Gm6685-201ENSMUST00000042595 764 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gde1Q9JL56 Gm10135-201ENSMUST00000043711 252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gde1Q9JL56 Krtap4-2-201ENSMUST00000058987 974 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gde1Q9JL56 Gm25517-201ENSMUST00000083865 134 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Gde1Q9JL56 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gde1Q9JL56 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gde1Q9JL56 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gde1Q9JL56 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gde1Q9JL56 Gm3765-201ENSMUST00000130985 1447 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Gde1Q9JL56 Rabggtb-202ENSMUST00000167111 1418 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gde1Q9JL56 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gde1Q9JL56 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gde1Q9JL56 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gde1Q9JL56 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gde1Q9JL56 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gde1Q9JL56 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Gde1Q9JL56 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gde1Q9JL56 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gde1Q9JL56 Gm12198-201ENSMUST00000154068 1809 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gde1Q9JL56 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms