Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKS4

Ldb3, LIM domain-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb3Q9JKS4 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ldb3Q9JKS4 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ldb3Q9JKS4 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ldb3Q9JKS4 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ldb3Q9JKS4 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ldb3Q9JKS4 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ldb3Q9JKS4 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ldb3Q9JKS4 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ldb3Q9JKS4 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ldb3Q9JKS4 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ldb3Q9JKS4 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ldb3Q9JKS4 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Ldb3Q9JKS4 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Ldb3Q9JKS4 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Ldb3Q9JKS4 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ldb3Q9JKS4 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ldb3Q9JKS4 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ldb3Q9JKS4 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ldb3Q9JKS4 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Ldb3Q9JKS4 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Ldb3Q9JKS4 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ldb3Q9JKS4 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ldb3Q9JKS4 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ldb3Q9JKS4 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Ldb3Q9JKS4 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ldb3Q9JKS4 AC073947.1-201ENSMUST00000216991 649 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Ldb3Q9JKS4 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ldb3Q9JKS4 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ldb3Q9JKS4 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ldb3Q9JKS4 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ldb3Q9JKS4 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ldb3Q9JKS4 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ldb3Q9JKS4 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ldb3Q9JKS4 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ldb3Q9JKS4 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ldb3Q9JKS4 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Ldb3Q9JKS4 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ldb3Q9JKS4 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Ldb3Q9JKS4 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ldb3Q9JKS4 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ldb3Q9JKS4 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ldb3Q9JKS4 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ldb3Q9JKS4 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ldb3Q9JKS4 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ldb3Q9JKS4 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ldb3Q9JKS4 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ldb3Q9JKS4 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ldb3Q9JKS4 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ldb3Q9JKS4 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ldb3Q9JKS4 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ldb3Q9JKS4 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ldb3Q9JKS4 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ldb3Q9JKS4 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ldb3Q9JKS4 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ldb3Q9JKS4 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ldb3Q9JKS4 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ldb3Q9JKS4 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ldb3Q9JKS4 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ldb3Q9JKS4 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ldb3Q9JKS4 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ldb3Q9JKS4 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ldb3Q9JKS4 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ldb3Q9JKS4 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ldb3Q9JKS4 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ldb3Q9JKS4 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ldb3Q9JKS4 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ldb3Q9JKS4 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Ldb3Q9JKS4 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Ldb3Q9JKS4 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Ldb3Q9JKS4 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ldb3Q9JKS4 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ldb3Q9JKS4 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ldb3Q9JKS4 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ldb3Q9JKS4 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Ldb3Q9JKS4 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ldb3Q9JKS4 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Ldb3Q9JKS4 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Ldb3Q9JKS4 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Ldb3Q9JKS4 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ldb3Q9JKS4 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Ldb3Q9JKS4 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Ldb3Q9JKS4 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ldb3Q9JKS4 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Ldb3Q9JKS4 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ldb3Q9JKS4 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ldb3Q9JKS4 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Ldb3Q9JKS4 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ldb3Q9JKS4 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ldb3Q9JKS4 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ldb3Q9JKS4 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ldb3Q9JKS4 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ldb3Q9JKS4 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ldb3Q9JKS4 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ldb3Q9JKS4 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ldb3Q9JKS4 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ldb3Q9JKS4 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ldb3Q9JKS4 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Ldb3Q9JKS4 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ldb3Q9JKS4 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ldb3Q9JKS4 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.8 ms