Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER65

Clstn2, Calsyntenin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn2Q9ER65 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Clstn2Q9ER65 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Clstn2Q9ER65 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Clstn2Q9ER65 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Clstn2Q9ER65 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Clstn2Q9ER65 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Clstn2Q9ER65 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Clstn2Q9ER65 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Clstn2Q9ER65 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Clstn2Q9ER65 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Clstn2Q9ER65 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Clstn2Q9ER65 Gm12798-201ENSMUST00000124786 666 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Clstn2Q9ER65 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Clstn2Q9ER65 Tlx1-202ENSMUST00000174617 806 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Clstn2Q9ER65 Ly6c1-202ENSMUST00000179762 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Clstn2Q9ER65 Gm8492-201ENSMUST00000182375 987 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Clstn2Q9ER65 3110031N09Rik-201ENSMUST00000201115 326 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Clstn2Q9ER65 Gm42657-201ENSMUST00000201746 211 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Clstn2Q9ER65 Gm44315-201ENSMUST00000203041 219 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Clstn2Q9ER65 Gm45338-201ENSMUST00000209198 820 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Clstn2Q9ER65 Cinp-204ENSMUST00000221102 536 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Clstn2Q9ER65 AC164437.3-201ENSMUST00000228323 347 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Clstn2Q9ER65 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Clstn2Q9ER65 Cmtm2a-201ENSMUST00000034344 1081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Clstn2Q9ER65 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Clstn2Q9ER65 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Clstn2Q9ER65 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Clstn2Q9ER65 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Clstn2Q9ER65 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Clstn2Q9ER65 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Clstn2Q9ER65 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Clstn2Q9ER65 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Clstn2Q9ER65 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Clstn2Q9ER65 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Clstn2Q9ER65 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Clstn2Q9ER65 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Clstn2Q9ER65 Pmp22-202ENSMUST00000108700 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Clstn2Q9ER65 Pcnp-203ENSMUST00000119981 901 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Clstn2Q9ER65 Gm15619-201ENSMUST00000128415 1294 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Clstn2Q9ER65 Gm14236-201ENSMUST00000142374 872 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Clstn2Q9ER65 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Clstn2Q9ER65 Gm44158-201ENSMUST00000203881 505 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Clstn2Q9ER65 Folr2-203ENSMUST00000210598 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Clstn2Q9ER65 Gm31166-202ENSMUST00000210638 1268 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Clstn2Q9ER65 Gm29961-201ENSMUST00000214692 644 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Clstn2Q9ER65 CT009546.1-201ENSMUST00000222573 1120 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Clstn2Q9ER65 Scg5-201ENSMUST00000024005 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Clstn2Q9ER65 Taar9-201ENSMUST00000041180 1047 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Clstn2Q9ER65 Gm4978-201ENSMUST00000071565 801 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Clstn2Q9ER65 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Clstn2Q9ER65 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Clstn2Q9ER65 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Clstn2Q9ER65 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Clstn2Q9ER65 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Clstn2Q9ER65 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Clstn2Q9ER65 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Clstn2Q9ER65 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Clstn2Q9ER65 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Clstn2Q9ER65 Oc90-202ENSMUST00000079776 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Clstn2Q9ER65 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Clstn2Q9ER65 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Clstn2Q9ER65 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Clstn2Q9ER65 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Clstn2Q9ER65 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Clstn2Q9ER65 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Clstn2Q9ER65 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Clstn2Q9ER65 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Clstn2Q9ER65 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Clstn2Q9ER65 Bri3-202ENSMUST00000110695 669 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Clstn2Q9ER65 Gm16397-201ENSMUST00000122201 494 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Clstn2Q9ER65 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Clstn2Q9ER65 Csmd2os-202ENSMUST00000179945 643 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Clstn2Q9ER65 AC166341.2-201ENSMUST00000220571 120 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Clstn2Q9ER65 Ccdc28b-201ENSMUST00000030586 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Clstn2Q9ER65 BC030499-201ENSMUST00000046361 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Clstn2Q9ER65 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Clstn2Q9ER65 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Clstn2Q9ER65 Rab30-202ENSMUST00000107179 1304 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Clstn2Q9ER65 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Clstn2Q9ER65 Gm26783-201ENSMUST00000181197 2377 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Clstn2Q9ER65 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Clstn2Q9ER65 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Clstn2Q9ER65 Lyplal1-201ENSMUST00000045388 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Clstn2Q9ER65 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Clstn2Q9ER65 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Clstn2Q9ER65 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Clstn2Q9ER65 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Clstn2Q9ER65 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Clstn2Q9ER65 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Clstn2Q9ER65 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Clstn2Q9ER65 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Clstn2Q9ER65 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Clstn2Q9ER65 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Clstn2Q9ER65 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Clstn2Q9ER65 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Clstn2Q9ER65 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Clstn2Q9ER65 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Clstn2Q9ER65 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Clstn2Q9ER65 A230006K03Rik-201ENSMUST00000107533 977 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Clstn2Q9ER65 Polr2i-203ENSMUST00000108193 488 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms