Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB40

Med27, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 27, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med27Q9DB40 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Med27Q9DB40 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Med27Q9DB40 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Med27Q9DB40 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Med27Q9DB40 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Med27Q9DB40 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Med27Q9DB40 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Med27Q9DB40 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Med27Q9DB40 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Med27Q9DB40 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Med27Q9DB40 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Med27Q9DB40 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Med27Q9DB40 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Med27Q9DB40 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Med27Q9DB40 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Med27Q9DB40 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Med27Q9DB40 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Med27Q9DB40 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Med27Q9DB40 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Med27Q9DB40 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Med27Q9DB40 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Med27Q9DB40 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Med27Q9DB40 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Med27Q9DB40 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Med27Q9DB40 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Med27Q9DB40 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Med27Q9DB40 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Med27Q9DB40 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Med27Q9DB40 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Med27Q9DB40 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Med27Q9DB40 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Med27Q9DB40 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Med27Q9DB40 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Med27Q9DB40 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Med27Q9DB40 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Med27Q9DB40 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Med27Q9DB40 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Med27Q9DB40 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Med27Q9DB40 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Med27Q9DB40 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Med27Q9DB40 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Med27Q9DB40 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Med27Q9DB40 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Med27Q9DB40 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Med27Q9DB40 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Med27Q9DB40 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Med27Q9DB40 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Med27Q9DB40 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Med27Q9DB40 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Med27Q9DB40 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Med27Q9DB40 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Med27Q9DB40 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Med27Q9DB40 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Med27Q9DB40 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Med27Q9DB40 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Med27Q9DB40 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Med27Q9DB40 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Med27Q9DB40 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Med27Q9DB40 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Med27Q9DB40 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Med27Q9DB40 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Med27Q9DB40 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Med27Q9DB40 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Med27Q9DB40 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Med27Q9DB40 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Med27Q9DB40 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Med27Q9DB40 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Med27Q9DB40 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Med27Q9DB40 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Med27Q9DB40 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Med27Q9DB40 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Med27Q9DB40 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Med27Q9DB40 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Med27Q9DB40 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Med27Q9DB40 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Med27Q9DB40 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Med27Q9DB40 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Med27Q9DB40 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Med27Q9DB40 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Med27Q9DB40 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Med27Q9DB40 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Med27Q9DB40 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Med27Q9DB40 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Med27Q9DB40 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Med27Q9DB40 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Med27Q9DB40 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Med27Q9DB40 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Med27Q9DB40 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Med27Q9DB40 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Med27Q9DB40 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Med27Q9DB40 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Med27Q9DB40 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Med27Q9DB40 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Med27Q9DB40 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Med27Q9DB40 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Med27Q9DB40 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Med27Q9DB40 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Med27Q9DB40 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Med27Q9DB40 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Med27Q9DB40 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
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