Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M4

Pdzd9, PDZ domain-containing protein 9, mousemouse

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Length 266 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd9Q9D9M4 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pdzd9Q9D9M4 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pdzd9Q9D9M4 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pdzd9Q9D9M4 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pdzd9Q9D9M4 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
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Pdzd9Q9D9M4 Snhg8-201ENSMUST00000196466 448 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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Pdzd9Q9D9M4 Mgp-201ENSMUST00000032342 617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pdzd9Q9D9M4 Chmp3-202ENSMUST00000065364 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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Pdzd9Q9D9M4 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pdzd9Q9D9M4 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pdzd9Q9D9M4 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pdzd9Q9D9M4 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pdzd9Q9D9M4 Brd4-202ENSMUST00000114475 2731 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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Pdzd9Q9D9M4 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pdzd9Q9D9M4 1700010I14Rik-201ENSMUST00000024650 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pdzd9Q9D9M4 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pdzd9Q9D9M4 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pdzd9Q9D9M4 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pdzd9Q9D9M4 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pdzd9Q9D9M4 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pdzd9Q9D9M4 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pdzd9Q9D9M4 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pdzd9Q9D9M4 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Pdzd9Q9D9M4 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pdzd9Q9D9M4 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
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Pdzd9Q9D9M4 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
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Pdzd9Q9D9M4 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pdzd9Q9D9M4 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pdzd9Q9D9M4 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pdzd9Q9D9M4 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Pdzd9Q9D9M4 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pdzd9Q9D9M4 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pdzd9Q9D9M4 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Pdzd9Q9D9M4 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pdzd9Q9D9M4 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pdzd9Q9D9M4 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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Pdzd9Q9D9M4 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pdzd9Q9D9M4 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pdzd9Q9D9M4 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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Pdzd9Q9D9M4 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pdzd9Q9D9M4 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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Pdzd9Q9D9M4 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pdzd9Q9D9M4 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pdzd9Q9D9M4 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pdzd9Q9D9M4 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pdzd9Q9D9M4 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Pdzd9Q9D9M4 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pdzd9Q9D9M4 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pdzd9Q9D9M4 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pdzd9Q9D9M4 Rpl22-204ENSMUST00000139685 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pdzd9Q9D9M4 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pdzd9Q9D9M4 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pdzd9Q9D9M4 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pdzd9Q9D9M4 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Pdzd9Q9D9M4 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pdzd9Q9D9M4 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pdzd9Q9D9M4 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pdzd9Q9D9M4 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pdzd9Q9D9M4 Gm18642-201ENSMUST00000206642 1400 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Pdzd9Q9D9M4 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Pdzd9Q9D9M4 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pdzd9Q9D9M4 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Pdzd9Q9D9M4 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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